Protein–RNA interactions for Protein: P51944

Ccnf, Cyclin-F, mousemouse

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Length 777 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnfP51944 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CcnfP51944 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CcnfP51944 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CcnfP51944 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CcnfP51944 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CcnfP51944 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CcnfP51944 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CcnfP51944 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CcnfP51944 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CcnfP51944 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CcnfP51944 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CcnfP51944 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CcnfP51944 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CcnfP51944 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CcnfP51944 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CcnfP51944 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CcnfP51944 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CcnfP51944 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CcnfP51944 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CcnfP51944 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CcnfP51944 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CcnfP51944 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CcnfP51944 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CcnfP51944 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CcnfP51944 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CcnfP51944 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CcnfP51944 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CcnfP51944 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CcnfP51944 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CcnfP51944 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CcnfP51944 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CcnfP51944 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CcnfP51944 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CcnfP51944 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CcnfP51944 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CcnfP51944 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CcnfP51944 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CcnfP51944 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CcnfP51944 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CcnfP51944 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CcnfP51944 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CcnfP51944 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CcnfP51944 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CcnfP51944 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CcnfP51944 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CcnfP51944 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CcnfP51944 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CcnfP51944 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CcnfP51944 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CcnfP51944 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CcnfP51944 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CcnfP51944 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CcnfP51944 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CcnfP51944 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CcnfP51944 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CcnfP51944 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CcnfP51944 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CcnfP51944 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CcnfP51944 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CcnfP51944 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CcnfP51944 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CcnfP51944 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CcnfP51944 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CcnfP51944 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CcnfP51944 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CcnfP51944 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CcnfP51944 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CcnfP51944 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CcnfP51944 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CcnfP51944 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CcnfP51944 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CcnfP51944 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CcnfP51944 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CcnfP51944 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CcnfP51944 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CcnfP51944 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CcnfP51944 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CcnfP51944 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CcnfP51944 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CcnfP51944 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CcnfP51944 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CcnfP51944 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CcnfP51944 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CcnfP51944 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CcnfP51944 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CcnfP51944 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CcnfP51944 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CcnfP51944 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CcnfP51944 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CcnfP51944 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CcnfP51944 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CcnfP51944 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CcnfP51944 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CcnfP51944 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CcnfP51944 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CcnfP51944 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CcnfP51944 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CcnfP51944 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CcnfP51944 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CcnfP51944 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
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