Protein–RNA interactions for Protein: P50706

Defa8, Alpha-defensin 8 (Fragment), mousemouse

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa8P50706 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Defa8P50706 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Defa8P50706 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Defa8P50706 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Defa8P50706 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Defa8P50706 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Defa8P50706 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Defa8P50706 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Defa8P50706 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Defa8P50706 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Defa8P50706 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Defa8P50706 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Defa8P50706 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Defa8P50706 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Defa8P50706 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Defa8P50706 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Defa8P50706 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Defa8P50706 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Defa8P50706 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Defa8P50706 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Defa8P50706 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Defa8P50706 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Defa8P50706 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Defa8P50706 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Defa8P50706 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Defa8P50706 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Defa8P50706 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Defa8P50706 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Defa8P50706 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Defa8P50706 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Defa8P50706 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Defa8P50706 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Defa8P50706 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Defa8P50706 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Defa8P50706 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Defa8P50706 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Defa8P50706 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Defa8P50706 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Defa8P50706 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Defa8P50706 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Defa8P50706 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Defa8P50706 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Defa8P50706 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Defa8P50706 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Defa8P50706 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Defa8P50706 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Defa8P50706 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Defa8P50706 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Defa8P50706 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Defa8P50706 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Defa8P50706 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Defa8P50706 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Defa8P50706 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Defa8P50706 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Defa8P50706 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Defa8P50706 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Defa8P50706 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Defa8P50706 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Defa8P50706 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Defa8P50706 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Defa8P50706 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Defa8P50706 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Defa8P50706 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Defa8P50706 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Defa8P50706 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Defa8P50706 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Defa8P50706 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Defa8P50706 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Defa8P50706 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Defa8P50706 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Defa8P50706 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Defa8P50706 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Defa8P50706 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Defa8P50706 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Defa8P50706 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Defa8P50706 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Defa8P50706 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Defa8P50706 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Defa8P50706 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Defa8P50706 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Defa8P50706 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Defa8P50706 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Defa8P50706 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Defa8P50706 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Defa8P50706 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Defa8P50706 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Defa8P50706 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Defa8P50706 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Defa8P50706 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Defa8P50706 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Defa8P50706 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Defa8P50706 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Defa8P50706 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Defa8P50706 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Defa8P50706 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Defa8P50706 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Defa8P50706 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Defa8P50706 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Defa8P50706 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Defa8P50706 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms