Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PtpreP49446 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PtpreP49446 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PtpreP49446 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PtpreP49446 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PtpreP49446 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PtpreP49446 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PtpreP49446 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PtpreP49446 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PtpreP49446 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PtpreP49446 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PtpreP49446 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PtpreP49446 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PtpreP49446 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PtpreP49446 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PtpreP49446 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PtpreP49446 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PtpreP49446 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PtpreP49446 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PtpreP49446 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PtpreP49446 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PtpreP49446 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PtpreP49446 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PtpreP49446 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PtpreP49446 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PtpreP49446 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PtpreP49446 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PtpreP49446 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PtpreP49446 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PtpreP49446 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PtpreP49446 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PtpreP49446 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PtpreP49446 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PtpreP49446 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PtpreP49446 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PtpreP49446 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PtpreP49446 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PtpreP49446 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PtpreP49446 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PtpreP49446 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PtpreP49446 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PtpreP49446 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PtpreP49446 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PtpreP49446 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PtpreP49446 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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PtpreP49446 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
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PtpreP49446 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
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PtpreP49446 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PtpreP49446 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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PtpreP49446 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PtpreP49446 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PtpreP49446 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PtpreP49446 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PtpreP49446 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PtpreP49446 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PtpreP49446 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PtpreP49446 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
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PtpreP49446 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PtpreP49446 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PtpreP49446 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PtpreP49446 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PtpreP49446 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PtpreP49446 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PtpreP49446 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PtpreP49446 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PtpreP49446 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PtpreP49446 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PtpreP49446 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PtpreP49446 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PtpreP49446 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PtpreP49446 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PtpreP49446 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PtpreP49446 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PtpreP49446 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PtpreP49446 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms