Protein–RNA interactions for Protein: P48410

Abcd1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd1P48410 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Abcd1P48410 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Abcd1P48410 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Abcd1P48410 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Abcd1P48410 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Abcd1P48410 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Abcd1P48410 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Abcd1P48410 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Abcd1P48410 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Abcd1P48410 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Abcd1P48410 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Abcd1P48410 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Abcd1P48410 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Abcd1P48410 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Abcd1P48410 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Abcd1P48410 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Abcd1P48410 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Abcd1P48410 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Abcd1P48410 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Abcd1P48410 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Abcd1P48410 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Abcd1P48410 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Abcd1P48410 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Abcd1P48410 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Abcd1P48410 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Abcd1P48410 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Abcd1P48410 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Abcd1P48410 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Abcd1P48410 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Abcd1P48410 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Abcd1P48410 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Abcd1P48410 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Abcd1P48410 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Abcd1P48410 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Abcd1P48410 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Abcd1P48410 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Abcd1P48410 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Abcd1P48410 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Abcd1P48410 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Abcd1P48410 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Abcd1P48410 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Abcd1P48410 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Abcd1P48410 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Abcd1P48410 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Abcd1P48410 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Abcd1P48410 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Abcd1P48410 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Abcd1P48410 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Abcd1P48410 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Abcd1P48410 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Abcd1P48410 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Abcd1P48410 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Abcd1P48410 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Abcd1P48410 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Abcd1P48410 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Abcd1P48410 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Abcd1P48410 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Abcd1P48410 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Abcd1P48410 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Abcd1P48410 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Abcd1P48410 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Abcd1P48410 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Abcd1P48410 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Abcd1P48410 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Abcd1P48410 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Abcd1P48410 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Abcd1P48410 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Abcd1P48410 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Abcd1P48410 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Abcd1P48410 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Abcd1P48410 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Abcd1P48410 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Abcd1P48410 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Abcd1P48410 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Abcd1P48410 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Abcd1P48410 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Abcd1P48410 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Abcd1P48410 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Abcd1P48410 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Abcd1P48410 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Abcd1P48410 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Abcd1P48410 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Abcd1P48410 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Abcd1P48410 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Abcd1P48410 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Abcd1P48410 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Abcd1P48410 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Abcd1P48410 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Abcd1P48410 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Abcd1P48410 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Abcd1P48410 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Abcd1P48410 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Abcd1P48410 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Abcd1P48410 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Abcd1P48410 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Abcd1P48410 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Abcd1P48410 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Abcd1P48410 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Abcd1P48410 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Abcd1P48410 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms