Protein–RNA interactions for Protein: P46638

Rab11b, Ras-related protein Rab-11B, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11bP46638 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rab11bP46638 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rab11bP46638 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rab11bP46638 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rab11bP46638 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rab11bP46638 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rab11bP46638 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rab11bP46638 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rab11bP46638 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rab11bP46638 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rab11bP46638 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rab11bP46638 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rab11bP46638 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rab11bP46638 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rab11bP46638 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rab11bP46638 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rab11bP46638 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rab11bP46638 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rab11bP46638 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rab11bP46638 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rab11bP46638 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Rab11bP46638 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rab11bP46638 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rab11bP46638 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rab11bP46638 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Rab11bP46638 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rab11bP46638 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rab11bP46638 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rab11bP46638 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rab11bP46638 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rab11bP46638 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rab11bP46638 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rab11bP46638 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rab11bP46638 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rab11bP46638 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rab11bP46638 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rab11bP46638 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Rab11bP46638 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rab11bP46638 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rab11bP46638 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rab11bP46638 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rab11bP46638 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rab11bP46638 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rab11bP46638 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rab11bP46638 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rab11bP46638 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rab11bP46638 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rab11bP46638 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rab11bP46638 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rab11bP46638 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rab11bP46638 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rab11bP46638 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rab11bP46638 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Rab11bP46638 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rab11bP46638 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rab11bP46638 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rab11bP46638 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rab11bP46638 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rab11bP46638 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rab11bP46638 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rab11bP46638 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rab11bP46638 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rab11bP46638 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rab11bP46638 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rab11bP46638 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rab11bP46638 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rab11bP46638 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rab11bP46638 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rab11bP46638 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rab11bP46638 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rab11bP46638 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rab11bP46638 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Rab11bP46638 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rab11bP46638 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rab11bP46638 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rab11bP46638 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Rab11bP46638 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rab11bP46638 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rab11bP46638 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rab11bP46638 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rab11bP46638 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rab11bP46638 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rab11bP46638 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rab11bP46638 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rab11bP46638 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rab11bP46638 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rab11bP46638 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rab11bP46638 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rab11bP46638 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rab11bP46638 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rab11bP46638 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rab11bP46638 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rab11bP46638 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rab11bP46638 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rab11bP46638 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rab11bP46638 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rab11bP46638 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rab11bP46638 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rab11bP46638 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rab11bP46638 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms