Protein–RNA interactions for Protein: P41969

Elk1, ETS domain-containing protein Elk-1, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Elk1P41969 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Elk1P41969 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Elk1P41969 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Elk1P41969 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Elk1P41969 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Elk1P41969 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Elk1P41969 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Elk1P41969 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Elk1P41969 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Elk1P41969 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Elk1P41969 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Elk1P41969 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Elk1P41969 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Elk1P41969 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Elk1P41969 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Elk1P41969 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Elk1P41969 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Elk1P41969 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Elk1P41969 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Elk1P41969 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Elk1P41969 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Elk1P41969 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Elk1P41969 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Elk1P41969 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Elk1P41969 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Elk1P41969 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Elk1P41969 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Elk1P41969 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Elk1P41969 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Elk1P41969 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Elk1P41969 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Elk1P41969 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Elk1P41969 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Elk1P41969 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Elk1P41969 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Elk1P41969 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Elk1P41969 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Elk1P41969 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Elk1P41969 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Elk1P41969 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Elk1P41969 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Elk1P41969 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Elk1P41969 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Elk1P41969 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Elk1P41969 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Elk1P41969 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Elk1P41969 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Elk1P41969 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Elk1P41969 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Elk1P41969 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Elk1P41969 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Elk1P41969 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Elk1P41969 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Elk1P41969 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Elk1P41969 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Elk1P41969 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Elk1P41969 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Elk1P41969 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Elk1P41969 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Elk1P41969 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Elk1P41969 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Elk1P41969 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Elk1P41969 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Elk1P41969 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Elk1P41969 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Elk1P41969 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Elk1P41969 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Elk1P41969 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Elk1P41969 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Elk1P41969 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Elk1P41969 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Elk1P41969 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Elk1P41969 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Elk1P41969 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Elk1P41969 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Elk1P41969 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Elk1P41969 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Elk1P41969 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Elk1P41969 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Elk1P41969 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Elk1P41969 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Elk1P41969 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Elk1P41969 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Elk1P41969 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Elk1P41969 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Elk1P41969 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Elk1P41969 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Elk1P41969 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Elk1P41969 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Elk1P41969 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Elk1P41969 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Elk1P41969 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Elk1P41969 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Elk1P41969 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Elk1P41969 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Elk1P41969 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Elk1P41969 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Elk1P41969 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Elk1P41969 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Elk1P41969 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms