Protein–RNA interactions for Protein: P41539

Tac1, Protachykinin-1, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tac1P41539 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tac1P41539 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tac1P41539 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tac1P41539 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tac1P41539 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tac1P41539 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tac1P41539 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tac1P41539 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tac1P41539 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tac1P41539 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tac1P41539 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tac1P41539 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tac1P41539 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tac1P41539 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tac1P41539 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tac1P41539 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tac1P41539 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tac1P41539 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tac1P41539 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tac1P41539 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tac1P41539 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tac1P41539 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tac1P41539 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tac1P41539 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tac1P41539 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tac1P41539 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Tac1P41539 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tac1P41539 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tac1P41539 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tac1P41539 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tac1P41539 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tac1P41539 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tac1P41539 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tac1P41539 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Tac1P41539 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tac1P41539 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tac1P41539 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tac1P41539 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tac1P41539 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tac1P41539 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tac1P41539 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tac1P41539 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tac1P41539 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tac1P41539 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tac1P41539 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tac1P41539 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tac1P41539 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tac1P41539 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tac1P41539 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tac1P41539 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tac1P41539 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tac1P41539 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tac1P41539 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tac1P41539 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tac1P41539 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tac1P41539 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tac1P41539 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tac1P41539 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tac1P41539 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tac1P41539 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tac1P41539 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tac1P41539 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tac1P41539 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tac1P41539 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tac1P41539 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tac1P41539 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tac1P41539 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tac1P41539 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tac1P41539 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tac1P41539 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tac1P41539 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tac1P41539 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tac1P41539 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tac1P41539 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tac1P41539 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tac1P41539 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tac1P41539 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tac1P41539 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tac1P41539 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tac1P41539 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tac1P41539 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tac1P41539 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tac1P41539 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tac1P41539 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tac1P41539 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tac1P41539 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tac1P41539 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tac1P41539 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tac1P41539 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tac1P41539 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tac1P41539 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tac1P41539 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tac1P41539 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tac1P41539 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tac1P41539 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tac1P41539 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tac1P41539 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tac1P41539 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tac1P41539 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tac1P41539 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms