Protein–RNA interactions for Protein: P41245

Mmp9, Matrix metalloproteinase-9, mousemouse

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Length 730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp9P41245 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Mmp9P41245 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Mmp9P41245 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Mmp9P41245 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Mmp9P41245 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Mmp9P41245 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Mmp9P41245 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Mmp9P41245 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Mmp9P41245 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Mmp9P41245 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Mmp9P41245 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Mmp9P41245 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Mmp9P41245 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Mmp9P41245 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Mmp9P41245 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Mmp9P41245 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Mmp9P41245 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Mmp9P41245 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Mmp9P41245 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Mmp9P41245 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Mmp9P41245 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Mmp9P41245 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Mmp9P41245 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Mmp9P41245 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Mmp9P41245 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Mmp9P41245 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Mmp9P41245 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Mmp9P41245 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Mmp9P41245 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Mmp9P41245 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Mmp9P41245 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Mmp9P41245 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Mmp9P41245 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Mmp9P41245 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Mmp9P41245 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Mmp9P41245 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Mmp9P41245 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Mmp9P41245 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Mmp9P41245 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Mmp9P41245 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Mmp9P41245 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Mmp9P41245 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Mmp9P41245 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Mmp9P41245 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Mmp9P41245 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Mmp9P41245 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Mmp9P41245 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Mmp9P41245 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Mmp9P41245 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Mmp9P41245 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Mmp9P41245 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Mmp9P41245 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Mmp9P41245 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Mmp9P41245 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Mmp9P41245 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Mmp9P41245 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Mmp9P41245 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Mmp9P41245 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mmp9P41245 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mmp9P41245 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mmp9P41245 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mmp9P41245 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mmp9P41245 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mmp9P41245 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mmp9P41245 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mmp9P41245 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mmp9P41245 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mmp9P41245 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mmp9P41245 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mmp9P41245 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mmp9P41245 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mmp9P41245 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mmp9P41245 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mmp9P41245 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mmp9P41245 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mmp9P41245 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mmp9P41245 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mmp9P41245 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mmp9P41245 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mmp9P41245 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mmp9P41245 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mmp9P41245 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mmp9P41245 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mmp9P41245 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mmp9P41245 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mmp9P41245 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mmp9P41245 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mmp9P41245 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mmp9P41245 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mmp9P41245 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mmp9P41245 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mmp9P41245 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mmp9P41245 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mmp9P41245 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mmp9P41245 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mmp9P41245 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mmp9P41245 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mmp9P41245 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mmp9P41245 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Mmp9P41245 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
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