Protein–RNA interactions for Protein: P35821

Ptpn1, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 1, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn1P35821 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ptpn1P35821 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ptpn1P35821 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ptpn1P35821 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ptpn1P35821 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ptpn1P35821 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ptpn1P35821 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ptpn1P35821 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ptpn1P35821 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ptpn1P35821 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ptpn1P35821 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ptpn1P35821 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ptpn1P35821 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ptpn1P35821 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ptpn1P35821 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ptpn1P35821 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ptpn1P35821 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ptpn1P35821 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ptpn1P35821 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ptpn1P35821 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ptpn1P35821 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ptpn1P35821 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ptpn1P35821 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ptpn1P35821 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ptpn1P35821 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ptpn1P35821 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ptpn1P35821 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ptpn1P35821 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ptpn1P35821 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ptpn1P35821 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ptpn1P35821 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ptpn1P35821 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ptpn1P35821 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ptpn1P35821 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ptpn1P35821 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ptpn1P35821 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ptpn1P35821 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ptpn1P35821 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ptpn1P35821 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ptpn1P35821 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ptpn1P35821 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Ptpn1P35821 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Ptpn1P35821 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ptpn1P35821 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ptpn1P35821 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ptpn1P35821 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ptpn1P35821 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Ptpn1P35821 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ptpn1P35821 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ptpn1P35821 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ptpn1P35821 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ptpn1P35821 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ptpn1P35821 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ptpn1P35821 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ptpn1P35821 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ptpn1P35821 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ptpn1P35821 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ptpn1P35821 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ptpn1P35821 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ptpn1P35821 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ptpn1P35821 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ptpn1P35821 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ptpn1P35821 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ptpn1P35821 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Ptpn1P35821 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ptpn1P35821 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ptpn1P35821 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ptpn1P35821 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Ptpn1P35821 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Ptpn1P35821 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Ptpn1P35821 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ptpn1P35821 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ptpn1P35821 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ptpn1P35821 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ptpn1P35821 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ptpn1P35821 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ptpn1P35821 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ptpn1P35821 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ptpn1P35821 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ptpn1P35821 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ptpn1P35821 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ptpn1P35821 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ptpn1P35821 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ptpn1P35821 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ptpn1P35821 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ptpn1P35821 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ptpn1P35821 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ptpn1P35821 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ptpn1P35821 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ptpn1P35821 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ptpn1P35821 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ptpn1P35821 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ptpn1P35821 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ptpn1P35821 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Ptpn1P35821 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ptpn1P35821 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ptpn1P35821 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ptpn1P35821 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ptpn1P35821 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ptpn1P35821 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms