Protein–RNA interactions for Protein: P34960

Mmp12, Macrophage metalloelastase, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp12P34960 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mmp12P34960 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mmp12P34960 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mmp12P34960 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mmp12P34960 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Mmp12P34960 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mmp12P34960 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mmp12P34960 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mmp12P34960 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mmp12P34960 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mmp12P34960 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mmp12P34960 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mmp12P34960 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mmp12P34960 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mmp12P34960 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mmp12P34960 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mmp12P34960 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mmp12P34960 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mmp12P34960 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mmp12P34960 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mmp12P34960 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mmp12P34960 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mmp12P34960 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mmp12P34960 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mmp12P34960 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mmp12P34960 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mmp12P34960 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mmp12P34960 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mmp12P34960 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mmp12P34960 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mmp12P34960 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mmp12P34960 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mmp12P34960 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Mmp12P34960 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mmp12P34960 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mmp12P34960 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mmp12P34960 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mmp12P34960 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mmp12P34960 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mmp12P34960 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mmp12P34960 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mmp12P34960 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mmp12P34960 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mmp12P34960 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mmp12P34960 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mmp12P34960 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mmp12P34960 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mmp12P34960 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mmp12P34960 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mmp12P34960 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mmp12P34960 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mmp12P34960 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mmp12P34960 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mmp12P34960 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mmp12P34960 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mmp12P34960 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mmp12P34960 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Mmp12P34960 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mmp12P34960 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mmp12P34960 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mmp12P34960 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mmp12P34960 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mmp12P34960 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mmp12P34960 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mmp12P34960 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mmp12P34960 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mmp12P34960 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mmp12P34960 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mmp12P34960 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mmp12P34960 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mmp12P34960 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mmp12P34960 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mmp12P34960 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mmp12P34960 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Mmp12P34960 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mmp12P34960 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mmp12P34960 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mmp12P34960 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mmp12P34960 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mmp12P34960 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mmp12P34960 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mmp12P34960 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mmp12P34960 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mmp12P34960 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mmp12P34960 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mmp12P34960 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mmp12P34960 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mmp12P34960 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mmp12P34960 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mmp12P34960 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mmp12P34960 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mmp12P34960 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mmp12P34960 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Mmp12P34960 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mmp12P34960 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mmp12P34960 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mmp12P34960 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mmp12P34960 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Mmp12P34960 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Mmp12P34960 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms