Protein–RNA interactions for Protein: P34928

Apoc1, Apolipoprotein C-I, mousemouse

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Length 88 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc1P34928 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Apoc1P34928 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Apoc1P34928 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Apoc1P34928 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Apoc1P34928 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Apoc1P34928 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Apoc1P34928 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Apoc1P34928 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Apoc1P34928 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Apoc1P34928 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Apoc1P34928 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Apoc1P34928 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Apoc1P34928 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Apoc1P34928 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Apoc1P34928 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Apoc1P34928 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Apoc1P34928 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Apoc1P34928 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Apoc1P34928 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Apoc1P34928 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Apoc1P34928 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Apoc1P34928 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Apoc1P34928 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Apoc1P34928 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Apoc1P34928 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Apoc1P34928 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Apoc1P34928 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Apoc1P34928 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Apoc1P34928 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Apoc1P34928 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Apoc1P34928 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Apoc1P34928 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Apoc1P34928 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Apoc1P34928 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Apoc1P34928 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Apoc1P34928 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Apoc1P34928 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Apoc1P34928 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Apoc1P34928 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Apoc1P34928 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Apoc1P34928 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Apoc1P34928 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Apoc1P34928 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Apoc1P34928 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Apoc1P34928 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Apoc1P34928 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Apoc1P34928 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Apoc1P34928 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Apoc1P34928 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Apoc1P34928 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Apoc1P34928 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Apoc1P34928 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Apoc1P34928 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Apoc1P34928 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Apoc1P34928 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Apoc1P34928 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Apoc1P34928 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Apoc1P34928 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Apoc1P34928 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Apoc1P34928 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Apoc1P34928 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Apoc1P34928 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Apoc1P34928 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Apoc1P34928 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Apoc1P34928 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Apoc1P34928 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Apoc1P34928 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Apoc1P34928 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Apoc1P34928 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Apoc1P34928 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Apoc1P34928 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Apoc1P34928 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Apoc1P34928 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Apoc1P34928 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Apoc1P34928 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Apoc1P34928 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Apoc1P34928 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Apoc1P34928 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Apoc1P34928 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Apoc1P34928 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Apoc1P34928 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Apoc1P34928 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Apoc1P34928 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Apoc1P34928 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Apoc1P34928 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Apoc1P34928 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Apoc1P34928 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Apoc1P34928 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Apoc1P34928 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Apoc1P34928 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Apoc1P34928 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Apoc1P34928 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Apoc1P34928 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Apoc1P34928 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Apoc1P34928 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Apoc1P34928 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Apoc1P34928 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Apoc1P34928 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Apoc1P34928 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Apoc1P34928 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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