Protein–RNA interactions for Protein: P33609

Pola1, DNA polymerase alpha catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 1,465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pola1P33609 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pola1P33609 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Pola1P33609 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pola1P33609 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pola1P33609 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pola1P33609 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pola1P33609 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pola1P33609 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pola1P33609 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pola1P33609 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Pola1P33609 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pola1P33609 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pola1P33609 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Pola1P33609 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Pola1P33609 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Pola1P33609 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Pola1P33609 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Pola1P33609 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Pola1P33609 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Pola1P33609 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Pola1P33609 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Pola1P33609 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Pola1P33609 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Pola1P33609 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Pola1P33609 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Pola1P33609 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pola1P33609 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pola1P33609 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pola1P33609 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pola1P33609 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pola1P33609 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pola1P33609 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pola1P33609 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pola1P33609 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pola1P33609 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pola1P33609 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Pola1P33609 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Pola1P33609 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pola1P33609 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pola1P33609 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Pola1P33609 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pola1P33609 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pola1P33609 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pola1P33609 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pola1P33609 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pola1P33609 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pola1P33609 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pola1P33609 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pola1P33609 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pola1P33609 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pola1P33609 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pola1P33609 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pola1P33609 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pola1P33609 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pola1P33609 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pola1P33609 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pola1P33609 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pola1P33609 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pola1P33609 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Pola1P33609 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pola1P33609 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pola1P33609 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Pola1P33609 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pola1P33609 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pola1P33609 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Pola1P33609 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pola1P33609 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pola1P33609 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pola1P33609 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pola1P33609 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pola1P33609 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Pola1P33609 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pola1P33609 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Pola1P33609 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pola1P33609 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pola1P33609 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pola1P33609 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pola1P33609 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pola1P33609 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pola1P33609 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pola1P33609 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pola1P33609 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pola1P33609 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pola1P33609 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pola1P33609 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pola1P33609 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Pola1P33609 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Pola1P33609 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pola1P33609 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pola1P33609 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pola1P33609 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pola1P33609 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pola1P33609 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pola1P33609 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pola1P33609 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pola1P33609 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pola1P33609 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pola1P33609 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pola1P33609 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pola1P33609 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms