Protein–RNA interactions for Protein: P30999

Ctnnd1, Catenin delta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 938 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnd1P30999 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ctnnd1P30999 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ctnnd1P30999 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ctnnd1P30999 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ctnnd1P30999 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ctnnd1P30999 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ctnnd1P30999 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ctnnd1P30999 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ctnnd1P30999 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ctnnd1P30999 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctnnd1P30999 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctnnd1P30999 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctnnd1P30999 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctnnd1P30999 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctnnd1P30999 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctnnd1P30999 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctnnd1P30999 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctnnd1P30999 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctnnd1P30999 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctnnd1P30999 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctnnd1P30999 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctnnd1P30999 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctnnd1P30999 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctnnd1P30999 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctnnd1P30999 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctnnd1P30999 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctnnd1P30999 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctnnd1P30999 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctnnd1P30999 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctnnd1P30999 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctnnd1P30999 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctnnd1P30999 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctnnd1P30999 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ctnnd1P30999 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ctnnd1P30999 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ctnnd1P30999 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ctnnd1P30999 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ctnnd1P30999 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ctnnd1P30999 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Ctnnd1P30999 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Ctnnd1P30999 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ctnnd1P30999 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ctnnd1P30999 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ctnnd1P30999 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ctnnd1P30999 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ctnnd1P30999 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ctnnd1P30999 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ctnnd1P30999 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ctnnd1P30999 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ctnnd1P30999 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ctnnd1P30999 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ctnnd1P30999 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ctnnd1P30999 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ctnnd1P30999 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ctnnd1P30999 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ctnnd1P30999 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ctnnd1P30999 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Ctnnd1P30999 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Ctnnd1P30999 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ctnnd1P30999 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ctnnd1P30999 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ctnnd1P30999 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ctnnd1P30999 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ctnnd1P30999 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ctnnd1P30999 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ctnnd1P30999 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ctnnd1P30999 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ctnnd1P30999 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ctnnd1P30999 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ctnnd1P30999 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ctnnd1P30999 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Ctnnd1P30999 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ctnnd1P30999 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ctnnd1P30999 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ctnnd1P30999 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ctnnd1P30999 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ctnnd1P30999 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Ctnnd1P30999 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Ctnnd1P30999 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ctnnd1P30999 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ctnnd1P30999 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ctnnd1P30999 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ctnnd1P30999 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ctnnd1P30999 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ctnnd1P30999 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ctnnd1P30999 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ctnnd1P30999 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ctnnd1P30999 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ctnnd1P30999 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ctnnd1P30999 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ctnnd1P30999 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ctnnd1P30999 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ctnnd1P30999 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ctnnd1P30999 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ctnnd1P30999 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ctnnd1P30999 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ctnnd1P30999 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ctnnd1P30999 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ctnnd1P30999 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ctnnd1P30999 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms