Protein–RNA interactions for Protein: P28654

Dcn, Decorin, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DcnP28654 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DcnP28654 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DcnP28654 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DcnP28654 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DcnP28654 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DcnP28654 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DcnP28654 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DcnP28654 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DcnP28654 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DcnP28654 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DcnP28654 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DcnP28654 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DcnP28654 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DcnP28654 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DcnP28654 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DcnP28654 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DcnP28654 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DcnP28654 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DcnP28654 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DcnP28654 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DcnP28654 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DcnP28654 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DcnP28654 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DcnP28654 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DcnP28654 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DcnP28654 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DcnP28654 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DcnP28654 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DcnP28654 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DcnP28654 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DcnP28654 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DcnP28654 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DcnP28654 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DcnP28654 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DcnP28654 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DcnP28654 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DcnP28654 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DcnP28654 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DcnP28654 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DcnP28654 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DcnP28654 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DcnP28654 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DcnP28654 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DcnP28654 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DcnP28654 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DcnP28654 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DcnP28654 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DcnP28654 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DcnP28654 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DcnP28654 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DcnP28654 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DcnP28654 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DcnP28654 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DcnP28654 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DcnP28654 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DcnP28654 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DcnP28654 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DcnP28654 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DcnP28654 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DcnP28654 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DcnP28654 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
DcnP28654 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DcnP28654 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DcnP28654 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DcnP28654 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DcnP28654 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DcnP28654 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DcnP28654 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DcnP28654 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
DcnP28654 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DcnP28654 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DcnP28654 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DcnP28654 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DcnP28654 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DcnP28654 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DcnP28654 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DcnP28654 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DcnP28654 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DcnP28654 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DcnP28654 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DcnP28654 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
DcnP28654 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DcnP28654 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DcnP28654 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DcnP28654 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DcnP28654 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DcnP28654 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DcnP28654 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DcnP28654 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DcnP28654 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DcnP28654 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DcnP28654 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DcnP28654 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DcnP28654 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DcnP28654 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DcnP28654 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DcnP28654 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DcnP28654 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DcnP28654 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DcnP28654 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms