Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxd9P28357 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxd9P28357 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxd9P28357 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxd9P28357 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxd9P28357 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxd9P28357 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxd9P28357 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxd9P28357 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxd9P28357 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxd9P28357 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxd9P28357 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxd9P28357 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxd9P28357 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxd9P28357 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxd9P28357 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxd9P28357 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxd9P28357 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxd9P28357 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxd9P28357 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxd9P28357 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxd9P28357 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxd9P28357 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxd9P28357 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxd9P28357 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxd9P28357 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxd9P28357 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxd9P28357 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxd9P28357 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxd9P28357 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxd9P28357 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxd9P28357 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxd9P28357 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxd9P28357 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxd9P28357 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxd9P28357 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxd9P28357 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxd9P28357 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxd9P28357 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxd9P28357 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxd9P28357 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxd9P28357 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxd9P28357 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxd9P28357 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxd9P28357 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxd9P28357 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxd9P28357 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxd9P28357 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxd9P28357 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxd9P28357 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxd9P28357 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxd9P28357 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxd9P28357 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxd9P28357 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Hoxd9P28357 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
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Hoxd9P28357 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxd9P28357 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxd9P28357 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxd9P28357 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxd9P28357 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxd9P28357 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxd9P28357 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxd9P28357 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxd9P28357 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Hoxd9P28357 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxd9P28357 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxd9P28357 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxd9P28357 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxd9P28357 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxd9P28357 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxd9P28357 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxd9P28357 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxd9P28357 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxd9P28357 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxd9P28357 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxd9P28357 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxd9P28357 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxd9P28357 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxd9P28357 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxd9P28357 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxd9P28357 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxd9P28357 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxd9P28357 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxd9P28357 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxd9P28357 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxd9P28357 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxd9P28357 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxd9P28357 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxd9P28357 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxd9P28357 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxd9P28357 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxd9P28357 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxd9P28357 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxd9P28357 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms