Protein–RNA interactions for Protein: P28235

Gja4, Gap junction alpha-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja4P28235 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gja4P28235 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gja4P28235 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gja4P28235 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gja4P28235 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gja4P28235 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gja4P28235 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gja4P28235 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gja4P28235 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gja4P28235 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gja4P28235 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gja4P28235 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gja4P28235 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gja4P28235 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gja4P28235 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gja4P28235 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gja4P28235 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gja4P28235 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gja4P28235 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gja4P28235 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gja4P28235 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Gja4P28235 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gja4P28235 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gja4P28235 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gja4P28235 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gja4P28235 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gja4P28235 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Gja4P28235 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gja4P28235 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gja4P28235 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gja4P28235 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Gja4P28235 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gja4P28235 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gja4P28235 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gja4P28235 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gja4P28235 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gja4P28235 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gja4P28235 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gja4P28235 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gja4P28235 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gja4P28235 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gja4P28235 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gja4P28235 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gja4P28235 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gja4P28235 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gja4P28235 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gja4P28235 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gja4P28235 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gja4P28235 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gja4P28235 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gja4P28235 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Gja4P28235 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gja4P28235 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gja4P28235 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Gja4P28235 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gja4P28235 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gja4P28235 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gja4P28235 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gja4P28235 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gja4P28235 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gja4P28235 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gja4P28235 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gja4P28235 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gja4P28235 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gja4P28235 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gja4P28235 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gja4P28235 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gja4P28235 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gja4P28235 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gja4P28235 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gja4P28235 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gja4P28235 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gja4P28235 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gja4P28235 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Gja4P28235 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gja4P28235 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gja4P28235 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gja4P28235 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gja4P28235 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gja4P28235 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gja4P28235 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Gja4P28235 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gja4P28235 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Gja4P28235 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gja4P28235 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gja4P28235 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gja4P28235 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gja4P28235 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gja4P28235 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gja4P28235 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gja4P28235 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gja4P28235 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gja4P28235 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gja4P28235 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gja4P28235 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gja4P28235 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gja4P28235 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gja4P28235 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gja4P28235 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gja4P28235 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.6 ms