Protein–RNA interactions for Protein: P26049

Gabra3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra3P26049 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabra3P26049 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabra3P26049 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabra3P26049 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabra3P26049 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabra3P26049 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabra3P26049 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabra3P26049 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabra3P26049 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabra3P26049 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabra3P26049 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabra3P26049 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabra3P26049 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabra3P26049 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabra3P26049 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabra3P26049 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabra3P26049 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabra3P26049 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabra3P26049 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabra3P26049 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabra3P26049 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabra3P26049 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabra3P26049 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabra3P26049 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gabra3P26049 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gabra3P26049 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gabra3P26049 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gabra3P26049 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gabra3P26049 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gabra3P26049 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gabra3P26049 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gabra3P26049 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gabra3P26049 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gabra3P26049 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gabra3P26049 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gabra3P26049 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gabra3P26049 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gabra3P26049 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gabra3P26049 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gabra3P26049 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gabra3P26049 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gabra3P26049 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gabra3P26049 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gabra3P26049 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gabra3P26049 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gabra3P26049 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabra3P26049 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabra3P26049 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabra3P26049 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabra3P26049 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabra3P26049 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabra3P26049 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabra3P26049 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabra3P26049 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabra3P26049 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabra3P26049 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabra3P26049 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabra3P26049 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabra3P26049 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabra3P26049 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabra3P26049 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabra3P26049 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabra3P26049 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabra3P26049 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabra3P26049 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabra3P26049 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabra3P26049 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabra3P26049 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabra3P26049 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabra3P26049 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabra3P26049 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabra3P26049 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabra3P26049 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabra3P26049 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabra3P26049 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabra3P26049 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabra3P26049 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabra3P26049 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabra3P26049 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabra3P26049 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabra3P26049 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabra3P26049 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabra3P26049 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabra3P26049 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabra3P26049 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabra3P26049 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabra3P26049 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabra3P26049 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabra3P26049 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabra3P26049 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabra3P26049 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabra3P26049 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabra3P26049 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabra3P26049 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabra3P26049 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabra3P26049 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabra3P26049 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabra3P26049 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabra3P26049 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabra3P26049 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms