Protein–RNA interactions for Protein: P21126

Ubl4a, Ubiquitin-like protein 4A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 157 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl4aP21126 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ubl4aP21126 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ubl4aP21126 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ubl4aP21126 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ubl4aP21126 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ubl4aP21126 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ubl4aP21126 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ubl4aP21126 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ubl4aP21126 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ubl4aP21126 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ubl4aP21126 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ubl4aP21126 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ubl4aP21126 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ubl4aP21126 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ubl4aP21126 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ubl4aP21126 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ubl4aP21126 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubl4aP21126 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubl4aP21126 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubl4aP21126 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubl4aP21126 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubl4aP21126 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubl4aP21126 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubl4aP21126 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubl4aP21126 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubl4aP21126 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubl4aP21126 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubl4aP21126 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubl4aP21126 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubl4aP21126 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubl4aP21126 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubl4aP21126 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubl4aP21126 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubl4aP21126 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubl4aP21126 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubl4aP21126 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubl4aP21126 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubl4aP21126 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubl4aP21126 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubl4aP21126 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubl4aP21126 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ubl4aP21126 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ubl4aP21126 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ubl4aP21126 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ubl4aP21126 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ubl4aP21126 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ubl4aP21126 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ubl4aP21126 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ubl4aP21126 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ubl4aP21126 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ubl4aP21126 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ubl4aP21126 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ubl4aP21126 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ubl4aP21126 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ubl4aP21126 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ubl4aP21126 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ubl4aP21126 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ubl4aP21126 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ubl4aP21126 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ubl4aP21126 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ubl4aP21126 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ubl4aP21126 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ubl4aP21126 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ubl4aP21126 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ubl4aP21126 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ubl4aP21126 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ubl4aP21126 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ubl4aP21126 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ubl4aP21126 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ubl4aP21126 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ubl4aP21126 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ubl4aP21126 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ubl4aP21126 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ubl4aP21126 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ubl4aP21126 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ubl4aP21126 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ubl4aP21126 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ubl4aP21126 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ubl4aP21126 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ubl4aP21126 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ubl4aP21126 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ubl4aP21126 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ubl4aP21126 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ubl4aP21126 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ubl4aP21126 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ubl4aP21126 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ubl4aP21126 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ubl4aP21126 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ubl4aP21126 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ubl4aP21126 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ubl4aP21126 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ubl4aP21126 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ubl4aP21126 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ubl4aP21126 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Ubl4aP21126 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ubl4aP21126 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ubl4aP21126 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ubl4aP21126 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ubl4aP21126 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ubl4aP21126 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms