Protein–RNA interactions for Protein: P20263

Pou5f1, POU domain, class 5, transcription factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou5f1P20263 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pou5f1P20263 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pou5f1P20263 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pou5f1P20263 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pou5f1P20263 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Pou5f1P20263 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Pou5f1P20263 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pou5f1P20263 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pou5f1P20263 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pou5f1P20263 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pou5f1P20263 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pou5f1P20263 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pou5f1P20263 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pou5f1P20263 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pou5f1P20263 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pou5f1P20263 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pou5f1P20263 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pou5f1P20263 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pou5f1P20263 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pou5f1P20263 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pou5f1P20263 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pou5f1P20263 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pou5f1P20263 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pou5f1P20263 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pou5f1P20263 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pou5f1P20263 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pou5f1P20263 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pou5f1P20263 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pou5f1P20263 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pou5f1P20263 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Pou5f1P20263 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
Pou5f1P20263 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pou5f1P20263 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pou5f1P20263 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pou5f1P20263 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pou5f1P20263 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pou5f1P20263 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pou5f1P20263 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pou5f1P20263 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Pou5f1P20263 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Pou5f1P20263 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Pou5f1P20263 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pou5f1P20263 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pou5f1P20263 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pou5f1P20263 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pou5f1P20263 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pou5f1P20263 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pou5f1P20263 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pou5f1P20263 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pou5f1P20263 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pou5f1P20263 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pou5f1P20263 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pou5f1P20263 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pou5f1P20263 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pou5f1P20263 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pou5f1P20263 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pou5f1P20263 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Pou5f1P20263 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pou5f1P20263 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pou5f1P20263 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pou5f1P20263 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pou5f1P20263 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pou5f1P20263 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pou5f1P20263 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pou5f1P20263 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pou5f1P20263 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pou5f1P20263 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pou5f1P20263 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pou5f1P20263 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pou5f1P20263 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pou5f1P20263 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pou5f1P20263 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pou5f1P20263 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pou5f1P20263 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pou5f1P20263 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pou5f1P20263 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pou5f1P20263 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pou5f1P20263 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pou5f1P20263 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pou5f1P20263 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Pou5f1P20263 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pou5f1P20263 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pou5f1P20263 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pou5f1P20263 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pou5f1P20263 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pou5f1P20263 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pou5f1P20263 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pou5f1P20263 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Pou5f1P20263 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pou5f1P20263 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Pou5f1P20263 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pou5f1P20263 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pou5f1P20263 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pou5f1P20263 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pou5f1P20263 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pou5f1P20263 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pou5f1P20263 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Pou5f1P20263 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pou5f1P20263 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pou5f1P20263 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms