Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
P20040 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
P20040 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
P20040 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
P20040 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
P20040 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
P20040 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
P20040 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
P20040 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
P20040 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
P20040 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
P20040 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
P20040 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
P20040 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
P20040 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
P20040 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
P20040 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
P20040 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
P20040 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
P20040 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
P20040 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
P20040 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
P20040 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
P20040 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
P20040 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
P20040 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
P20040 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
P20040 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
P20040 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
P20040 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
P20040 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
P20040 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
P20040 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
P20040 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
P20040 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
P20040 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
P20040 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
P20040 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
P20040 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
P20040 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
P20040 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
P20040 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
P20040 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
P20040 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
P20040 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
P20040 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
P20040 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
P20040 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
P20040 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
P20040 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
P20040 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
P20040 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
P20040 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
P20040 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
P20040 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
P20040 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
P20040 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
P20040 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
P20040 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
P20040 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
P20040 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
P20040 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
P20040 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
P20040 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
P20040 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
P20040 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
P20040 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
P20040 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
P20040 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
P20040 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
P20040 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
P20040 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P20040 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P20040 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P20040 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P20040 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
P20040 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P20040 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P20040 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
P20040 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P20040 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
P20040 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P20040 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P20040 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P20040 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P20040 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P20040 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P20040 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P20040 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P20040 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
P20040 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P20040 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
P20040 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
P20040 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
P20040 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P20040 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P20040 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P20040 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
P20040 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P20040 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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