Protein–RNA interactions for Protein: P18653

Rps6ka1, Ribosomal protein S6 kinase alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka1P18653 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rps6ka1P18653 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rps6ka1P18653 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rps6ka1P18653 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rps6ka1P18653 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rps6ka1P18653 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rps6ka1P18653 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rps6ka1P18653 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rps6ka1P18653 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rps6ka1P18653 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rps6ka1P18653 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rps6ka1P18653 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rps6ka1P18653 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rps6ka1P18653 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rps6ka1P18653 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rps6ka1P18653 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rps6ka1P18653 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rps6ka1P18653 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rps6ka1P18653 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rps6ka1P18653 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rps6ka1P18653 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rps6ka1P18653 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rps6ka1P18653 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Rps6ka1P18653 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rps6ka1P18653 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rps6ka1P18653 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rps6ka1P18653 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rps6ka1P18653 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rps6ka1P18653 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rps6ka1P18653 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rps6ka1P18653 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rps6ka1P18653 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rps6ka1P18653 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rps6ka1P18653 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Rps6ka1P18653 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rps6ka1P18653 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rps6ka1P18653 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rps6ka1P18653 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rps6ka1P18653 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rps6ka1P18653 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rps6ka1P18653 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rps6ka1P18653 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Rps6ka1P18653 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rps6ka1P18653 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rps6ka1P18653 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rps6ka1P18653 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rps6ka1P18653 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rps6ka1P18653 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Rps6ka1P18653 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rps6ka1P18653 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rps6ka1P18653 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rps6ka1P18653 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rps6ka1P18653 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rps6ka1P18653 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rps6ka1P18653 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rps6ka1P18653 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rps6ka1P18653 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rps6ka1P18653 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rps6ka1P18653 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rps6ka1P18653 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Rps6ka1P18653 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rps6ka1P18653 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rps6ka1P18653 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rps6ka1P18653 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rps6ka1P18653 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rps6ka1P18653 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Rps6ka1P18653 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rps6ka1P18653 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rps6ka1P18653 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rps6ka1P18653 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rps6ka1P18653 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rps6ka1P18653 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rps6ka1P18653 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rps6ka1P18653 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Rps6ka1P18653 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rps6ka1P18653 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rps6ka1P18653 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rps6ka1P18653 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rps6ka1P18653 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rps6ka1P18653 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rps6ka1P18653 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rps6ka1P18653 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rps6ka1P18653 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rps6ka1P18653 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rps6ka1P18653 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rps6ka1P18653 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rps6ka1P18653 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rps6ka1P18653 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rps6ka1P18653 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rps6ka1P18653 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rps6ka1P18653 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rps6ka1P18653 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rps6ka1P18653 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rps6ka1P18653 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rps6ka1P18653 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rps6ka1P18653 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rps6ka1P18653 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rps6ka1P18653 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rps6ka1P18653 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rps6ka1P18653 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms