Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vpreb2P13373 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vpreb2P13373 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vpreb2P13373 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vpreb2P13373 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vpreb2P13373 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vpreb2P13373 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vpreb2P13373 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vpreb2P13373 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vpreb2P13373 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vpreb2P13373 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vpreb2P13373 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vpreb2P13373 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Vpreb2P13373 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vpreb2P13373 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vpreb2P13373 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vpreb2P13373 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vpreb2P13373 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vpreb2P13373 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vpreb2P13373 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vpreb2P13373 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vpreb2P13373 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vpreb2P13373 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vpreb2P13373 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vpreb2P13373 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vpreb2P13373 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vpreb2P13373 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vpreb2P13373 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vpreb2P13373 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vpreb2P13373 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vpreb2P13373 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vpreb2P13373 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vpreb2P13373 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vpreb2P13373 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vpreb2P13373 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vpreb2P13373 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vpreb2P13373 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Vpreb2P13373 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vpreb2P13373 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vpreb2P13373 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vpreb2P13373 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vpreb2P13373 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vpreb2P13373 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vpreb2P13373 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vpreb2P13373 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vpreb2P13373 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vpreb2P13373 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vpreb2P13373 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vpreb2P13373 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vpreb2P13373 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vpreb2P13373 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vpreb2P13373 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vpreb2P13373 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vpreb2P13373 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vpreb2P13373 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vpreb2P13373 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vpreb2P13373 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vpreb2P13373 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vpreb2P13373 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vpreb2P13373 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vpreb2P13373 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vpreb2P13373 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vpreb2P13373 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Vpreb2P13373 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vpreb2P13373 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vpreb2P13373 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vpreb2P13373 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vpreb2P13373 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vpreb2P13373 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vpreb2P13373 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vpreb2P13373 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vpreb2P13373 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vpreb2P13373 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vpreb2P13373 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vpreb2P13373 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vpreb2P13373 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vpreb2P13373 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vpreb2P13373 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vpreb2P13373 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vpreb2P13373 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Vpreb2P13373 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vpreb2P13373 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vpreb2P13373 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vpreb2P13373 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vpreb2P13373 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vpreb2P13373 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vpreb2P13373 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vpreb2P13373 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vpreb2P13373 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vpreb2P13373 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vpreb2P13373 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vpreb2P13373 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vpreb2P13373 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Vpreb2P13373 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vpreb2P13373 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vpreb2P13373 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vpreb2P13373 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vpreb2P13373 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vpreb2P13373 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vpreb2P13373 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms