Protein–RNA interactions for Protein: P12399

Ctla2a, Protein CTLA-2-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctla2aP12399 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ctla2aP12399 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctla2aP12399 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctla2aP12399 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctla2aP12399 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctla2aP12399 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ctla2aP12399 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctla2aP12399 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctla2aP12399 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ctla2aP12399 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctla2aP12399 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctla2aP12399 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ctla2aP12399 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ctla2aP12399 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ctla2aP12399 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ctla2aP12399 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctla2aP12399 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctla2aP12399 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctla2aP12399 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctla2aP12399 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ctla2aP12399 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctla2aP12399 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctla2aP12399 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ctla2aP12399 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ctla2aP12399 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ctla2aP12399 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctla2aP12399 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctla2aP12399 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Ctla2aP12399 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ctla2aP12399 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctla2aP12399 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctla2aP12399 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctla2aP12399 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctla2aP12399 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ctla2aP12399 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctla2aP12399 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctla2aP12399 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ctla2aP12399 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ctla2aP12399 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ctla2aP12399 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ctla2aP12399 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ctla2aP12399 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ctla2aP12399 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ctla2aP12399 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ctla2aP12399 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ctla2aP12399 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ctla2aP12399 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ctla2aP12399 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ctla2aP12399 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ctla2aP12399 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ctla2aP12399 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ctla2aP12399 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ctla2aP12399 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ctla2aP12399 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ctla2aP12399 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ctla2aP12399 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ctla2aP12399 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Ctla2aP12399 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ctla2aP12399 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ctla2aP12399 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ctla2aP12399 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ctla2aP12399 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ctla2aP12399 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ctla2aP12399 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ctla2aP12399 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ctla2aP12399 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ctla2aP12399 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ctla2aP12399 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ctla2aP12399 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ctla2aP12399 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ctla2aP12399 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ctla2aP12399 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ctla2aP12399 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ctla2aP12399 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ctla2aP12399 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ctla2aP12399 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ctla2aP12399 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ctla2aP12399 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ctla2aP12399 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ctla2aP12399 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ctla2aP12399 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ctla2aP12399 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Ctla2aP12399 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ctla2aP12399 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ctla2aP12399 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ctla2aP12399 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ctla2aP12399 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ctla2aP12399 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ctla2aP12399 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ctla2aP12399 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ctla2aP12399 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ctla2aP12399 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ctla2aP12399 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ctla2aP12399 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ctla2aP12399 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ctla2aP12399 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ctla2aP12399 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ctla2aP12399 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ctla2aP12399 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ctla2aP12399 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms