Protein–RNA interactions for Protein: P11370

Fv4, Retrovirus-related Env polyprotein from Fv-4 locus, mousemouse

Predictions only

Length 679 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fv4P11370 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fv4P11370 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fv4P11370 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fv4P11370 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fv4P11370 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fv4P11370 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fv4P11370 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fv4P11370 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fv4P11370 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fv4P11370 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fv4P11370 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fv4P11370 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fv4P11370 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fv4P11370 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fv4P11370 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fv4P11370 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fv4P11370 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fv4P11370 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fv4P11370 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fv4P11370 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fv4P11370 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fv4P11370 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fv4P11370 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fv4P11370 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fv4P11370 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fv4P11370 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fv4P11370 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fv4P11370 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Fv4P11370 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fv4P11370 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Fv4P11370 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Fv4P11370 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fv4P11370 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fv4P11370 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fv4P11370 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fv4P11370 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fv4P11370 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fv4P11370 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fv4P11370 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fv4P11370 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fv4P11370 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fv4P11370 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fv4P11370 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fv4P11370 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fv4P11370 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fv4P11370 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fv4P11370 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Fv4P11370 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fv4P11370 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fv4P11370 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fv4P11370 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fv4P11370 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fv4P11370 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fv4P11370 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fv4P11370 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fv4P11370 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fv4P11370 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fv4P11370 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fv4P11370 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fv4P11370 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fv4P11370 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fv4P11370 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fv4P11370 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fv4P11370 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fv4P11370 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fv4P11370 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fv4P11370 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fv4P11370 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fv4P11370 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fv4P11370 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fv4P11370 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Fv4P11370 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fv4P11370 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fv4P11370 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fv4P11370 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fv4P11370 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fv4P11370 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fv4P11370 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fv4P11370 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fv4P11370 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fv4P11370 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fv4P11370 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fv4P11370 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Fv4P11370 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fv4P11370 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fv4P11370 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fv4P11370 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fv4P11370 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fv4P11370 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fv4P11370 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fv4P11370 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fv4P11370 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fv4P11370 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fv4P11370 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fv4P11370 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fv4P11370 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fv4P11370 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fv4P11370 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Fv4P11370 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fv4P11370 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms