Protein–RNA interactions for Protein: P10284

Hoxb4, Homeobox protein Hox-B4, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb4P10284 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxb4P10284 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxb4P10284 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxb4P10284 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxb4P10284 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxb4P10284 Cklf-210ENSMUST00000212939 737 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxb4P10284 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxb4P10284 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxb4P10284 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxb4P10284 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxb4P10284 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxb4P10284 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxb4P10284 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxb4P10284 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxb4P10284 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxb4P10284 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxb4P10284 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxb4P10284 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxb4P10284 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxb4P10284 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxb4P10284 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxb4P10284 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxb4P10284 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxb4P10284 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxb4P10284 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxb4P10284 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxb4P10284 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxb4P10284 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxb4P10284 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxb4P10284 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxb4P10284 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxb4P10284 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxb4P10284 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxb4P10284 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxb4P10284 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxb4P10284 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxb4P10284 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxb4P10284 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxb4P10284 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxb4P10284 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Hoxb4P10284 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxb4P10284 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxb4P10284 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxb4P10284 Gm28745-201ENSMUST00000190069 305 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxb4P10284 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxb4P10284 Gm45696-201ENSMUST00000212088 985 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxb4P10284 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxb4P10284 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxb4P10284 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxb4P10284 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxb4P10284 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxb4P10284 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxb4P10284 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxb4P10284 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxb4P10284 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxb4P10284 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxb4P10284 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxb4P10284 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxb4P10284 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxb4P10284 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxb4P10284 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxb4P10284 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxb4P10284 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxb4P10284 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxb4P10284 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxb4P10284 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxb4P10284 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxb4P10284 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxb4P10284 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxb4P10284 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxb4P10284 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxb4P10284 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxb4P10284 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxb4P10284 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxb4P10284 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxb4P10284 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxb4P10284 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxb4P10284 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxb4P10284 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxb4P10284 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxb4P10284 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxb4P10284 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxb4P10284 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxb4P10284 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxb4P10284 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxb4P10284 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxb4P10284 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxb4P10284 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxb4P10284 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxb4P10284 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxb4P10284 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxb4P10284 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxb4P10284 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxb4P10284 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxb4P10284 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxb4P10284 Gm12962-202ENSMUST00000144212 691 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxb4P10284 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxb4P10284 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxb4P10284 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxb4P10284 Id2-201ENSMUST00000020974 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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