Protein–RNA interactions for Protein: P04202

Tgfb1, Transforming growth factor beta-1, mousemouse

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Length 390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb1P04202 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tgfb1P04202 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tgfb1P04202 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tgfb1P04202 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tgfb1P04202 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tgfb1P04202 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tgfb1P04202 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tgfb1P04202 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tgfb1P04202 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tgfb1P04202 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tgfb1P04202 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tgfb1P04202 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tgfb1P04202 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tgfb1P04202 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tgfb1P04202 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tgfb1P04202 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tgfb1P04202 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tgfb1P04202 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tgfb1P04202 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tgfb1P04202 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tgfb1P04202 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tgfb1P04202 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tgfb1P04202 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tgfb1P04202 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tgfb1P04202 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tgfb1P04202 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tgfb1P04202 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tgfb1P04202 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tgfb1P04202 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tgfb1P04202 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tgfb1P04202 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tgfb1P04202 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tgfb1P04202 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tgfb1P04202 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tgfb1P04202 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tgfb1P04202 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tgfb1P04202 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tgfb1P04202 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tgfb1P04202 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tgfb1P04202 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tgfb1P04202 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tgfb1P04202 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tgfb1P04202 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tgfb1P04202 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tgfb1P04202 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tgfb1P04202 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tgfb1P04202 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tgfb1P04202 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tgfb1P04202 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tgfb1P04202 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tgfb1P04202 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tgfb1P04202 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tgfb1P04202 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tgfb1P04202 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tgfb1P04202 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tgfb1P04202 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tgfb1P04202 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tgfb1P04202 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tgfb1P04202 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tgfb1P04202 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tgfb1P04202 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tgfb1P04202 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tgfb1P04202 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tgfb1P04202 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tgfb1P04202 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tgfb1P04202 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tgfb1P04202 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tgfb1P04202 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tgfb1P04202 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tgfb1P04202 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tgfb1P04202 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tgfb1P04202 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tgfb1P04202 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tgfb1P04202 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tgfb1P04202 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tgfb1P04202 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tgfb1P04202 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tgfb1P04202 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tgfb1P04202 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tgfb1P04202 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tgfb1P04202 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tgfb1P04202 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tgfb1P04202 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tgfb1P04202 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tgfb1P04202 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tgfb1P04202 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tgfb1P04202 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tgfb1P04202 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tgfb1P04202 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tgfb1P04202 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tgfb1P04202 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tgfb1P04202 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tgfb1P04202 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tgfb1P04202 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tgfb1P04202 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tgfb1P04202 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tgfb1P04202 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tgfb1P04202 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tgfb1P04202 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tgfb1P04202 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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