Protein–RNA interactions for Protein: P03911

Mtnd4, NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtnd4P03911 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mtnd4P03911 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mtnd4P03911 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mtnd4P03911 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mtnd4P03911 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mtnd4P03911 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mtnd4P03911 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mtnd4P03911 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mtnd4P03911 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mtnd4P03911 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mtnd4P03911 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mtnd4P03911 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mtnd4P03911 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mtnd4P03911 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mtnd4P03911 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mtnd4P03911 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mtnd4P03911 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mtnd4P03911 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mtnd4P03911 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mtnd4P03911 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mtnd4P03911 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mtnd4P03911 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mtnd4P03911 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mtnd4P03911 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mtnd4P03911 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mtnd4P03911 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mtnd4P03911 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mtnd4P03911 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mtnd4P03911 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mtnd4P03911 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mtnd4P03911 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mtnd4P03911 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mtnd4P03911 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Mtnd4P03911 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mtnd4P03911 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mtnd4P03911 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mtnd4P03911 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mtnd4P03911 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mtnd4P03911 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mtnd4P03911 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mtnd4P03911 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mtnd4P03911 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mtnd4P03911 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mtnd4P03911 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mtnd4P03911 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mtnd4P03911 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mtnd4P03911 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mtnd4P03911 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mtnd4P03911 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mtnd4P03911 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mtnd4P03911 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mtnd4P03911 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mtnd4P03911 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mtnd4P03911 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mtnd4P03911 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mtnd4P03911 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mtnd4P03911 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mtnd4P03911 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mtnd4P03911 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mtnd4P03911 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mtnd4P03911 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mtnd4P03911 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mtnd4P03911 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mtnd4P03911 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mtnd4P03911 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mtnd4P03911 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mtnd4P03911 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mtnd4P03911 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Mtnd4P03911 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mtnd4P03911 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mtnd4P03911 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Mtnd4P03911 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Mtnd4P03911 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mtnd4P03911 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mtnd4P03911 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mtnd4P03911 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mtnd4P03911 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mtnd4P03911 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Mtnd4P03911 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Mtnd4P03911 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Mtnd4P03911 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Mtnd4P03911 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Mtnd4P03911 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Mtnd4P03911 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mtnd4P03911 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mtnd4P03911 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mtnd4P03911 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mtnd4P03911 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mtnd4P03911 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mtnd4P03911 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mtnd4P03911 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mtnd4P03911 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mtnd4P03911 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mtnd4P03911 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mtnd4P03911 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mtnd4P03911 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mtnd4P03911 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mtnd4P03911 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mtnd4P03911 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mtnd4P03911 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms