Protein–RNA interactions for Protein: P03888

Mtnd1, NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 1, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtnd1P03888 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mtnd1P03888 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mtnd1P03888 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Mtnd1P03888 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mtnd1P03888 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mtnd1P03888 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Mtnd1P03888 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mtnd1P03888 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mtnd1P03888 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mtnd1P03888 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mtnd1P03888 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mtnd1P03888 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mtnd1P03888 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mtnd1P03888 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mtnd1P03888 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mtnd1P03888 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mtnd1P03888 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mtnd1P03888 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mtnd1P03888 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mtnd1P03888 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mtnd1P03888 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mtnd1P03888 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mtnd1P03888 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mtnd1P03888 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Mtnd1P03888 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mtnd1P03888 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mtnd1P03888 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mtnd1P03888 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mtnd1P03888 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mtnd1P03888 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mtnd1P03888 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mtnd1P03888 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mtnd1P03888 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mtnd1P03888 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mtnd1P03888 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mtnd1P03888 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mtnd1P03888 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mtnd1P03888 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mtnd1P03888 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mtnd1P03888 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mtnd1P03888 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mtnd1P03888 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mtnd1P03888 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mtnd1P03888 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mtnd1P03888 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mtnd1P03888 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mtnd1P03888 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mtnd1P03888 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mtnd1P03888 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mtnd1P03888 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mtnd1P03888 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mtnd1P03888 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mtnd1P03888 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mtnd1P03888 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mtnd1P03888 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mtnd1P03888 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mtnd1P03888 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mtnd1P03888 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mtnd1P03888 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mtnd1P03888 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mtnd1P03888 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mtnd1P03888 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Mtnd1P03888 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mtnd1P03888 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mtnd1P03888 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mtnd1P03888 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mtnd1P03888 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mtnd1P03888 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Mtnd1P03888 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mtnd1P03888 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mtnd1P03888 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mtnd1P03888 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mtnd1P03888 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mtnd1P03888 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mtnd1P03888 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mtnd1P03888 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mtnd1P03888 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mtnd1P03888 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mtnd1P03888 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mtnd1P03888 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Mtnd1P03888 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mtnd1P03888 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mtnd1P03888 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mtnd1P03888 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mtnd1P03888 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mtnd1P03888 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mtnd1P03888 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mtnd1P03888 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mtnd1P03888 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mtnd1P03888 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mtnd1P03888 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mtnd1P03888 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mtnd1P03888 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mtnd1P03888 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mtnd1P03888 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mtnd1P03888 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mtnd1P03888 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Mtnd1P03888 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mtnd1P03888 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mtnd1P03888 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms