Protein–RNA interactions for Protein: O88384

Vti1b, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1B, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vti1bO88384 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vti1bO88384 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vti1bO88384 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vti1bO88384 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vti1bO88384 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vti1bO88384 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vti1bO88384 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vti1bO88384 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vti1bO88384 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vti1bO88384 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vti1bO88384 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vti1bO88384 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vti1bO88384 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vti1bO88384 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vti1bO88384 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vti1bO88384 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vti1bO88384 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vti1bO88384 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vti1bO88384 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vti1bO88384 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vti1bO88384 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vti1bO88384 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vti1bO88384 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vti1bO88384 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Vti1bO88384 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vti1bO88384 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vti1bO88384 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vti1bO88384 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vti1bO88384 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vti1bO88384 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vti1bO88384 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Vti1bO88384 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vti1bO88384 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vti1bO88384 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vti1bO88384 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vti1bO88384 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vti1bO88384 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vti1bO88384 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vti1bO88384 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vti1bO88384 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vti1bO88384 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vti1bO88384 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vti1bO88384 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vti1bO88384 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vti1bO88384 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vti1bO88384 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vti1bO88384 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vti1bO88384 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vti1bO88384 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vti1bO88384 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vti1bO88384 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vti1bO88384 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vti1bO88384 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vti1bO88384 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vti1bO88384 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vti1bO88384 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vti1bO88384 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vti1bO88384 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vti1bO88384 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vti1bO88384 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vti1bO88384 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vti1bO88384 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vti1bO88384 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vti1bO88384 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vti1bO88384 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vti1bO88384 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vti1bO88384 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vti1bO88384 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vti1bO88384 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vti1bO88384 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vti1bO88384 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vti1bO88384 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vti1bO88384 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vti1bO88384 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vti1bO88384 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vti1bO88384 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vti1bO88384 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vti1bO88384 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vti1bO88384 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vti1bO88384 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vti1bO88384 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vti1bO88384 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vti1bO88384 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vti1bO88384 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vti1bO88384 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vti1bO88384 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vti1bO88384 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vti1bO88384 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Vti1bO88384 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vti1bO88384 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vti1bO88384 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vti1bO88384 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vti1bO88384 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vti1bO88384 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Vti1bO88384 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vti1bO88384 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vti1bO88384 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vti1bO88384 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vti1bO88384 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vti1bO88384 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.4 ms