Protein–RNA interactions for Protein: O88346

Tnnt1, Troponin T, slow skeletal muscle, mousemouse

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Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt1O88346 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tnnt1O88346 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tnnt1O88346 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tnnt1O88346 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tnnt1O88346 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tnnt1O88346 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tnnt1O88346 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tnnt1O88346 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tnnt1O88346 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tnnt1O88346 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tnnt1O88346 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tnnt1O88346 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tnnt1O88346 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tnnt1O88346 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tnnt1O88346 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tnnt1O88346 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tnnt1O88346 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tnnt1O88346 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tnnt1O88346 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tnnt1O88346 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tnnt1O88346 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tnnt1O88346 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tnnt1O88346 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tnnt1O88346 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tnnt1O88346 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tnnt1O88346 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tnnt1O88346 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Tnnt1O88346 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tnnt1O88346 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tnnt1O88346 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tnnt1O88346 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tnnt1O88346 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tnnt1O88346 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tnnt1O88346 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Tnnt1O88346 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tnnt1O88346 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tnnt1O88346 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tnnt1O88346 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tnnt1O88346 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tnnt1O88346 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tnnt1O88346 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tnnt1O88346 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tnnt1O88346 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tnnt1O88346 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tnnt1O88346 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Tnnt1O88346 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tnnt1O88346 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tnnt1O88346 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tnnt1O88346 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tnnt1O88346 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tnnt1O88346 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tnnt1O88346 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tnnt1O88346 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Tnnt1O88346 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tnnt1O88346 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tnnt1O88346 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tnnt1O88346 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tnnt1O88346 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tnnt1O88346 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tnnt1O88346 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tnnt1O88346 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tnnt1O88346 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tnnt1O88346 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tnnt1O88346 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tnnt1O88346 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tnnt1O88346 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tnnt1O88346 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tnnt1O88346 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tnnt1O88346 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Tnnt1O88346 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tnnt1O88346 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tnnt1O88346 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tnnt1O88346 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tnnt1O88346 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tnnt1O88346 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tnnt1O88346 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tnnt1O88346 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Tnnt1O88346 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Tnnt1O88346 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tnnt1O88346 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tnnt1O88346 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tnnt1O88346 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tnnt1O88346 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tnnt1O88346 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tnnt1O88346 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tnnt1O88346 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tnnt1O88346 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tnnt1O88346 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Tnnt1O88346 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tnnt1O88346 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tnnt1O88346 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tnnt1O88346 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tnnt1O88346 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tnnt1O88346 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tnnt1O88346 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tnnt1O88346 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tnnt1O88346 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tnnt1O88346 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tnnt1O88346 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tnnt1O88346 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
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