Protein–RNA interactions for Protein: O54891

Lgals6, Galectin-6, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgals6O54891 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Lgals6O54891 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Lgals6O54891 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Lgals6O54891 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Lgals6O54891 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Lgals6O54891 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Lgals6O54891 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Lgals6O54891 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Lgals6O54891 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Lgals6O54891 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Lgals6O54891 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Lgals6O54891 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Lgals6O54891 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Lgals6O54891 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Lgals6O54891 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Lgals6O54891 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Lgals6O54891 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Lgals6O54891 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Lgals6O54891 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Lgals6O54891 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Lgals6O54891 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Lgals6O54891 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Lgals6O54891 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Lgals6O54891 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Lgals6O54891 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Lgals6O54891 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Lgals6O54891 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Lgals6O54891 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Lgals6O54891 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Lgals6O54891 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Lgals6O54891 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Lgals6O54891 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Lgals6O54891 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Lgals6O54891 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Lgals6O54891 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Lgals6O54891 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Lgals6O54891 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Lgals6O54891 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Lgals6O54891 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Lgals6O54891 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Lgals6O54891 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Lgals6O54891 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Lgals6O54891 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Lgals6O54891 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Lgals6O54891 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Lgals6O54891 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Lgals6O54891 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Lgals6O54891 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Lgals6O54891 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Lgals6O54891 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Lgals6O54891 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Lgals6O54891 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Lgals6O54891 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Lgals6O54891 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Lgals6O54891 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Lgals6O54891 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Lgals6O54891 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Lgals6O54891 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Lgals6O54891 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Lgals6O54891 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Lgals6O54891 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Lgals6O54891 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Lgals6O54891 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Lgals6O54891 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Lgals6O54891 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Lgals6O54891 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Lgals6O54891 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Lgals6O54891 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Lgals6O54891 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Lgals6O54891 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Lgals6O54891 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Lgals6O54891 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Lgals6O54891 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Lgals6O54891 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Lgals6O54891 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Lgals6O54891 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Lgals6O54891 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Lgals6O54891 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Lgals6O54891 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Lgals6O54891 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Lgals6O54891 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Lgals6O54891 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Lgals6O54891 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Lgals6O54891 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Lgals6O54891 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Lgals6O54891 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Lgals6O54891 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Lgals6O54891 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Lgals6O54891 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Lgals6O54891 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Lgals6O54891 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Lgals6O54891 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Lgals6O54891 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Lgals6O54891 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Lgals6O54891 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Lgals6O54891 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Lgals6O54891 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Lgals6O54891 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Lgals6O54891 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Lgals6O54891 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms