Protein–RNA interactions for Protein: O54751

Crx, Cone-rod homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxO54751 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CrxO54751 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
CrxO54751 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CrxO54751 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CrxO54751 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
CrxO54751 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
CrxO54751 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
CrxO54751 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
CrxO54751 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CrxO54751 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CrxO54751 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CrxO54751 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CrxO54751 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CrxO54751 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CrxO54751 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
CrxO54751 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CrxO54751 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CrxO54751 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CrxO54751 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CrxO54751 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CrxO54751 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CrxO54751 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CrxO54751 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CrxO54751 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CrxO54751 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CrxO54751 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
CrxO54751 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
CrxO54751 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CrxO54751 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CrxO54751 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
CrxO54751 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
CrxO54751 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CrxO54751 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CrxO54751 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CrxO54751 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
CrxO54751 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CrxO54751 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CrxO54751 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CrxO54751 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CrxO54751 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
CrxO54751 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
CrxO54751 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CrxO54751 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CrxO54751 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CrxO54751 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
CrxO54751 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CrxO54751 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
CrxO54751 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CrxO54751 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CrxO54751 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CrxO54751 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CrxO54751 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CrxO54751 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
CrxO54751 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CrxO54751 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
CrxO54751 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
CrxO54751 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
CrxO54751 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
CrxO54751 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
CrxO54751 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
CrxO54751 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
CrxO54751 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
CrxO54751 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
CrxO54751 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
CrxO54751 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
CrxO54751 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
CrxO54751 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
CrxO54751 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
CrxO54751 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
CrxO54751 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
CrxO54751 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
CrxO54751 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
CrxO54751 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
CrxO54751 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
CrxO54751 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
CrxO54751 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
CrxO54751 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
CrxO54751 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
CrxO54751 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
CrxO54751 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
CrxO54751 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
CrxO54751 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
CrxO54751 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
CrxO54751 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
CrxO54751 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
CrxO54751 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
CrxO54751 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
CrxO54751 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
CrxO54751 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
CrxO54751 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
CrxO54751 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
CrxO54751 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
CrxO54751 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC12.17□□□□□ -0.46
CrxO54751 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
CrxO54751 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
CrxO54751 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
CrxO54751 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
CrxO54751 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
CrxO54751 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
CrxO54751 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms