Protein–RNA interactions for Protein: O35955

Psmb10, Proteasome subunit beta type-10, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb10O35955 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psmb10O35955 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psmb10O35955 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psmb10O35955 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psmb10O35955 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psmb10O35955 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psmb10O35955 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psmb10O35955 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psmb10O35955 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psmb10O35955 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psmb10O35955 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psmb10O35955 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psmb10O35955 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psmb10O35955 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psmb10O35955 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psmb10O35955 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psmb10O35955 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psmb10O35955 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psmb10O35955 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psmb10O35955 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psmb10O35955 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psmb10O35955 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psmb10O35955 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psmb10O35955 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psmb10O35955 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psmb10O35955 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psmb10O35955 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psmb10O35955 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psmb10O35955 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psmb10O35955 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Psmb10O35955 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psmb10O35955 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psmb10O35955 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psmb10O35955 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psmb10O35955 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psmb10O35955 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psmb10O35955 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psmb10O35955 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psmb10O35955 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psmb10O35955 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psmb10O35955 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psmb10O35955 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psmb10O35955 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psmb10O35955 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psmb10O35955 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psmb10O35955 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psmb10O35955 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psmb10O35955 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psmb10O35955 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psmb10O35955 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psmb10O35955 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psmb10O35955 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psmb10O35955 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psmb10O35955 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psmb10O35955 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psmb10O35955 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psmb10O35955 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psmb10O35955 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psmb10O35955 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psmb10O35955 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psmb10O35955 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psmb10O35955 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psmb10O35955 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psmb10O35955 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psmb10O35955 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psmb10O35955 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psmb10O35955 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Psmb10O35955 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psmb10O35955 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psmb10O35955 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psmb10O35955 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psmb10O35955 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psmb10O35955 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psmb10O35955 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psmb10O35955 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psmb10O35955 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psmb10O35955 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psmb10O35955 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Psmb10O35955 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Psmb10O35955 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Psmb10O35955 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Psmb10O35955 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Psmb10O35955 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Psmb10O35955 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Psmb10O35955 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Psmb10O35955 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Psmb10O35955 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Psmb10O35955 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Psmb10O35955 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Psmb10O35955 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Psmb10O35955 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Psmb10O35955 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Psmb10O35955 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Psmb10O35955 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Psmb10O35955 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Psmb10O35955 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Psmb10O35955 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Psmb10O35955 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Psmb10O35955 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psmb10O35955 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms