Protein–RNA interactions for Protein: L7N2D9

Gm3239, Predicted gene 3239, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3239L7N2D9 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm3239L7N2D9 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm3239L7N2D9 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm3239L7N2D9 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm3239L7N2D9 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm3239L7N2D9 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm3239L7N2D9 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm3239L7N2D9 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm3239L7N2D9 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm3239L7N2D9 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm3239L7N2D9 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm3239L7N2D9 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm3239L7N2D9 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm3239L7N2D9 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm3239L7N2D9 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm3239L7N2D9 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm3239L7N2D9 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm3239L7N2D9 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Gm3239L7N2D9 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm3239L7N2D9 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm3239L7N2D9 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm3239L7N2D9 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Gm3239L7N2D9 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm3239L7N2D9 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm3239L7N2D9 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm3239L7N2D9 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm3239L7N2D9 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm3239L7N2D9 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm3239L7N2D9 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Gm3239L7N2D9 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm3239L7N2D9 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm3239L7N2D9 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Gm3239L7N2D9 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm3239L7N2D9 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Gm3239L7N2D9 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Gm3239L7N2D9 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3239L7N2D9 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Gm3239L7N2D9 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3239L7N2D9 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Gm3239L7N2D9 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Gm3239L7N2D9 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3239L7N2D9 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3239L7N2D9 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3239L7N2D9 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3239L7N2D9 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3239L7N2D9 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3239L7N2D9 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3239L7N2D9 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Gm3239L7N2D9 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3239L7N2D9 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3239L7N2D9 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3239L7N2D9 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3239L7N2D9 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3239L7N2D9 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3239L7N2D9 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3239L7N2D9 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3239L7N2D9 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3239L7N2D9 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3239L7N2D9 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3239L7N2D9 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3239L7N2D9 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3239L7N2D9 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3239L7N2D9 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3239L7N2D9 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3239L7N2D9 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3239L7N2D9 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3239L7N2D9 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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