Protein–RNA interactions for Protein: J3QP01

Gm5108, Predicted gene 5108, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5108J3QP01 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm5108J3QP01 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm5108J3QP01 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm5108J3QP01 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm5108J3QP01 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm5108J3QP01 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm5108J3QP01 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm5108J3QP01 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm5108J3QP01 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm5108J3QP01 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm5108J3QP01 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm5108J3QP01 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm5108J3QP01 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm5108J3QP01 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm5108J3QP01 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm5108J3QP01 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm5108J3QP01 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm5108J3QP01 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm5108J3QP01 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm5108J3QP01 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm5108J3QP01 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm5108J3QP01 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm5108J3QP01 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm5108J3QP01 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm5108J3QP01 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm5108J3QP01 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm5108J3QP01 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm5108J3QP01 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm5108J3QP01 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm5108J3QP01 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm5108J3QP01 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm5108J3QP01 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm5108J3QP01 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm5108J3QP01 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm5108J3QP01 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm5108J3QP01 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm5108J3QP01 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm5108J3QP01 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm5108J3QP01 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm5108J3QP01 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm5108J3QP01 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm5108J3QP01 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm5108J3QP01 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm5108J3QP01 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm5108J3QP01 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm5108J3QP01 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm5108J3QP01 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm5108J3QP01 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm5108J3QP01 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm5108J3QP01 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm5108J3QP01 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm5108J3QP01 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm5108J3QP01 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm5108J3QP01 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm5108J3QP01 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm5108J3QP01 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm5108J3QP01 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm5108J3QP01 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm5108J3QP01 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm5108J3QP01 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm5108J3QP01 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm5108J3QP01 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm5108J3QP01 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm5108J3QP01 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm5108J3QP01 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm5108J3QP01 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm5108J3QP01 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm5108J3QP01 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm5108J3QP01 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm5108J3QP01 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm5108J3QP01 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm5108J3QP01 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm5108J3QP01 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm5108J3QP01 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm5108J3QP01 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm5108J3QP01 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm5108J3QP01 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm5108J3QP01 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm5108J3QP01 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm5108J3QP01 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm5108J3QP01 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm5108J3QP01 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm5108J3QP01 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm5108J3QP01 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm5108J3QP01 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm5108J3QP01 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm5108J3QP01 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm5108J3QP01 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm5108J3QP01 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm5108J3QP01 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm5108J3QP01 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm5108J3QP01 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm5108J3QP01 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm5108J3QP01 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm5108J3QP01 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm5108J3QP01 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm5108J3QP01 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm5108J3QP01 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm5108J3QP01 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm5108J3QP01 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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