Protein–RNA interactions for Protein: G5E8Z2

Taf4b, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4bG5E8Z2 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Taf4bG5E8Z2 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Taf4bG5E8Z2 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Taf4bG5E8Z2 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Taf4bG5E8Z2 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Taf4bG5E8Z2 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Taf4bG5E8Z2 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Taf4bG5E8Z2 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Taf4bG5E8Z2 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Taf4bG5E8Z2 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Taf4bG5E8Z2 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Taf4bG5E8Z2 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Taf4bG5E8Z2 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Taf4bG5E8Z2 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Taf4bG5E8Z2 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Taf4bG5E8Z2 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Taf4bG5E8Z2 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Taf4bG5E8Z2 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Taf4bG5E8Z2 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Taf4bG5E8Z2 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Taf4bG5E8Z2 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Taf4bG5E8Z2 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Taf4bG5E8Z2 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Taf4bG5E8Z2 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Taf4bG5E8Z2 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Taf4bG5E8Z2 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Taf4bG5E8Z2 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Taf4bG5E8Z2 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Taf4bG5E8Z2 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Taf4bG5E8Z2 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Taf4bG5E8Z2 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Taf4bG5E8Z2 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Taf4bG5E8Z2 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Taf4bG5E8Z2 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Taf4bG5E8Z2 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Taf4bG5E8Z2 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Taf4bG5E8Z2 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Taf4bG5E8Z2 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Taf4bG5E8Z2 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Taf4bG5E8Z2 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Taf4bG5E8Z2 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Taf4bG5E8Z2 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Taf4bG5E8Z2 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Taf4bG5E8Z2 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Taf4bG5E8Z2 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Taf4bG5E8Z2 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Taf4bG5E8Z2 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Taf4bG5E8Z2 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Taf4bG5E8Z2 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Taf4bG5E8Z2 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Taf4bG5E8Z2 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Taf4bG5E8Z2 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Taf4bG5E8Z2 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Taf4bG5E8Z2 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Taf4bG5E8Z2 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Taf4bG5E8Z2 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Taf4bG5E8Z2 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Taf4bG5E8Z2 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Taf4bG5E8Z2 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Taf4bG5E8Z2 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Taf4bG5E8Z2 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Taf4bG5E8Z2 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Taf4bG5E8Z2 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Taf4bG5E8Z2 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Taf4bG5E8Z2 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Taf4bG5E8Z2 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Taf4bG5E8Z2 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Taf4bG5E8Z2 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Taf4bG5E8Z2 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Taf4bG5E8Z2 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Taf4bG5E8Z2 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Taf4bG5E8Z2 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Taf4bG5E8Z2 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Taf4bG5E8Z2 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Taf4bG5E8Z2 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Taf4bG5E8Z2 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Taf4bG5E8Z2 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Taf4bG5E8Z2 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Taf4bG5E8Z2 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Taf4bG5E8Z2 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Taf4bG5E8Z2 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Taf4bG5E8Z2 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Taf4bG5E8Z2 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Taf4bG5E8Z2 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Taf4bG5E8Z2 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Taf4bG5E8Z2 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Taf4bG5E8Z2 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Taf4bG5E8Z2 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Taf4bG5E8Z2 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Taf4bG5E8Z2 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Taf4bG5E8Z2 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Taf4bG5E8Z2 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Taf4bG5E8Z2 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Taf4bG5E8Z2 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Taf4bG5E8Z2 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Taf4bG5E8Z2 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Taf4bG5E8Z2 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Taf4bG5E8Z2 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Taf4bG5E8Z2 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Taf4bG5E8Z2 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms