Protein–RNA interactions for Protein: G3X9I7

Zc3h12b, MCG2522, mousemouse

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zc3h12bG3X9I7 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Zc3h12bG3X9I7 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Zc3h12bG3X9I7 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Zc3h12bG3X9I7 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Zc3h12bG3X9I7 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Zc3h12bG3X9I7 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Zc3h12bG3X9I7 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Zc3h12bG3X9I7 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Zc3h12bG3X9I7 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Zc3h12bG3X9I7 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Zc3h12bG3X9I7 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Zc3h12bG3X9I7 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Zc3h12bG3X9I7 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Zc3h12bG3X9I7 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Zc3h12bG3X9I7 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Zc3h12bG3X9I7 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Zc3h12bG3X9I7 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Zc3h12bG3X9I7 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Zc3h12bG3X9I7 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Zc3h12bG3X9I7 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Zc3h12bG3X9I7 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Zc3h12bG3X9I7 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Zc3h12bG3X9I7 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Zc3h12bG3X9I7 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Zc3h12bG3X9I7 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Zc3h12bG3X9I7 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Zc3h12bG3X9I7 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Zc3h12bG3X9I7 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Zc3h12bG3X9I7 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Zc3h12bG3X9I7 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Zc3h12bG3X9I7 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Zc3h12bG3X9I7 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Zc3h12bG3X9I7 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Zc3h12bG3X9I7 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Zc3h12bG3X9I7 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Zc3h12bG3X9I7 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Zc3h12bG3X9I7 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Zc3h12bG3X9I7 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Zc3h12bG3X9I7 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Zc3h12bG3X9I7 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Zc3h12bG3X9I7 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Zc3h12bG3X9I7 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Zc3h12bG3X9I7 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Zc3h12bG3X9I7 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Zc3h12bG3X9I7 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Zc3h12bG3X9I7 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Zc3h12bG3X9I7 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Zc3h12bG3X9I7 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Zc3h12bG3X9I7 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Zc3h12bG3X9I7 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Zc3h12bG3X9I7 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Zc3h12bG3X9I7 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Zc3h12bG3X9I7 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Zc3h12bG3X9I7 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Zc3h12bG3X9I7 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Zc3h12bG3X9I7 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Zc3h12bG3X9I7 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Zc3h12bG3X9I7 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Zc3h12bG3X9I7 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Zc3h12bG3X9I7 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Zc3h12bG3X9I7 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Zc3h12bG3X9I7 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Zc3h12bG3X9I7 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Zc3h12bG3X9I7 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Zc3h12bG3X9I7 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Zc3h12bG3X9I7 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Zc3h12bG3X9I7 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Zc3h12bG3X9I7 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Zc3h12bG3X9I7 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Zc3h12bG3X9I7 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Zc3h12bG3X9I7 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Zc3h12bG3X9I7 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Zc3h12bG3X9I7 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Zc3h12bG3X9I7 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Zc3h12bG3X9I7 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Zc3h12bG3X9I7 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Zc3h12bG3X9I7 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Zc3h12bG3X9I7 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Zc3h12bG3X9I7 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Zc3h12bG3X9I7 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Zc3h12bG3X9I7 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Zc3h12bG3X9I7 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Zc3h12bG3X9I7 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Zc3h12bG3X9I7 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Zc3h12bG3X9I7 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Zc3h12bG3X9I7 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Zc3h12bG3X9I7 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Zc3h12bG3X9I7 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Zc3h12bG3X9I7 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Zc3h12bG3X9I7 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Zc3h12bG3X9I7 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Zc3h12bG3X9I7 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Zc3h12bG3X9I7 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Zc3h12bG3X9I7 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Zc3h12bG3X9I7 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Zc3h12bG3X9I7 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Zc3h12bG3X9I7 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Zc3h12bG3X9I7 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Zc3h12bG3X9I7 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Zc3h12bG3X9I7 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms