Protein–RNA interactions for Protein: G3UW52

Cldn34a, Claudin 34A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34aG3UW52 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn34aG3UW52 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn34aG3UW52 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn34aG3UW52 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn34aG3UW52 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn34aG3UW52 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn34aG3UW52 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn34aG3UW52 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn34aG3UW52 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn34aG3UW52 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn34aG3UW52 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn34aG3UW52 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn34aG3UW52 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn34aG3UW52 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn34aG3UW52 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn34aG3UW52 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn34aG3UW52 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn34aG3UW52 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn34aG3UW52 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn34aG3UW52 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn34aG3UW52 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn34aG3UW52 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn34aG3UW52 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn34aG3UW52 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn34aG3UW52 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn34aG3UW52 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn34aG3UW52 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn34aG3UW52 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn34aG3UW52 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn34aG3UW52 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn34aG3UW52 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn34aG3UW52 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn34aG3UW52 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn34aG3UW52 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn34aG3UW52 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn34aG3UW52 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn34aG3UW52 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn34aG3UW52 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn34aG3UW52 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn34aG3UW52 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn34aG3UW52 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn34aG3UW52 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn34aG3UW52 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn34aG3UW52 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn34aG3UW52 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn34aG3UW52 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn34aG3UW52 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn34aG3UW52 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn34aG3UW52 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn34aG3UW52 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn34aG3UW52 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn34aG3UW52 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn34aG3UW52 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn34aG3UW52 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn34aG3UW52 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn34aG3UW52 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn34aG3UW52 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn34aG3UW52 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn34aG3UW52 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn34aG3UW52 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn34aG3UW52 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn34aG3UW52 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn34aG3UW52 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn34aG3UW52 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn34aG3UW52 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn34aG3UW52 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn34aG3UW52 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn34aG3UW52 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn34aG3UW52 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn34aG3UW52 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn34aG3UW52 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn34aG3UW52 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn34aG3UW52 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn34aG3UW52 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn34aG3UW52 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn34aG3UW52 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn34aG3UW52 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn34aG3UW52 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn34aG3UW52 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn34aG3UW52 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn34aG3UW52 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn34aG3UW52 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn34aG3UW52 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn34aG3UW52 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn34aG3UW52 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn34aG3UW52 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn34aG3UW52 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn34aG3UW52 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn34aG3UW52 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn34aG3UW52 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn34aG3UW52 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn34aG3UW52 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn34aG3UW52 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn34aG3UW52 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cldn34aG3UW52 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cldn34aG3UW52 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cldn34aG3UW52 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cldn34aG3UW52 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cldn34aG3UW52 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cldn34aG3UW52 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms