Protein–RNA interactions for Protein: F6VCN9

Gm5861, Predicted gene 5861 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5861F6VCN9 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5861F6VCN9 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5861F6VCN9 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5861F6VCN9 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5861F6VCN9 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5861F6VCN9 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5861F6VCN9 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5861F6VCN9 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5861F6VCN9 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5861F6VCN9 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5861F6VCN9 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5861F6VCN9 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gm5861F6VCN9 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5861F6VCN9 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5861F6VCN9 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5861F6VCN9 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gm5861F6VCN9 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5861F6VCN9 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5861F6VCN9 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5861F6VCN9 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5861F6VCN9 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5861F6VCN9 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5861F6VCN9 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5861F6VCN9 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5861F6VCN9 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5861F6VCN9 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5861F6VCN9 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5861F6VCN9 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5861F6VCN9 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5861F6VCN9 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5861F6VCN9 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5861F6VCN9 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5861F6VCN9 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5861F6VCN9 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5861F6VCN9 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Gm5861F6VCN9 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Gm5861F6VCN9 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5861F6VCN9 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5861F6VCN9 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5861F6VCN9 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5861F6VCN9 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5861F6VCN9 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5861F6VCN9 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5861F6VCN9 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5861F6VCN9 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5861F6VCN9 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5861F6VCN9 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5861F6VCN9 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5861F6VCN9 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Gm5861F6VCN9 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5861F6VCN9 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Gm5861F6VCN9 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5861F6VCN9 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Gm5861F6VCN9 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5861F6VCN9 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5861F6VCN9 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Gm5861F6VCN9 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5861F6VCN9 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5861F6VCN9 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5861F6VCN9 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5861F6VCN9 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5861F6VCN9 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5861F6VCN9 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5861F6VCN9 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5861F6VCN9 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5861F6VCN9 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5861F6VCN9 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5861F6VCN9 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5861F6VCN9 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5861F6VCN9 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5861F6VCN9 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5861F6VCN9 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5861F6VCN9 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5861F6VCN9 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5861F6VCN9 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5861F6VCN9 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5861F6VCN9 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5861F6VCN9 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5861F6VCN9 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5861F6VCN9 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5861F6VCN9 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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