Protein–RNA interactions for Protein: F6UK53

4933403O08Rik, MCG62900, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933403O08RikF6UK53 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4933403O08RikF6UK53 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4933403O08RikF6UK53 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4933403O08RikF6UK53 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4933403O08RikF6UK53 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
4933403O08RikF6UK53 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4933403O08RikF6UK53 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4933403O08RikF6UK53 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4933403O08RikF6UK53 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
4933403O08RikF6UK53 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
4933403O08RikF6UK53 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
4933403O08RikF6UK53 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
4933403O08RikF6UK53 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4933403O08RikF6UK53 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4933403O08RikF6UK53 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
4933403O08RikF6UK53 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4933403O08RikF6UK53 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4933403O08RikF6UK53 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4933403O08RikF6UK53 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4933403O08RikF6UK53 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4933403O08RikF6UK53 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4933403O08RikF6UK53 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
4933403O08RikF6UK53 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4933403O08RikF6UK53 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4933403O08RikF6UK53 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4933403O08RikF6UK53 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4933403O08RikF6UK53 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4933403O08RikF6UK53 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4933403O08RikF6UK53 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4933403O08RikF6UK53 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4933403O08RikF6UK53 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
4933403O08RikF6UK53 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4933403O08RikF6UK53 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4933403O08RikF6UK53 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4933403O08RikF6UK53 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4933403O08RikF6UK53 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
4933403O08RikF6UK53 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
4933403O08RikF6UK53 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
4933403O08RikF6UK53 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
4933403O08RikF6UK53 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
4933403O08RikF6UK53 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4933403O08RikF6UK53 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
4933403O08RikF6UK53 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4933403O08RikF6UK53 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4933403O08RikF6UK53 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4933403O08RikF6UK53 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
4933403O08RikF6UK53 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4933403O08RikF6UK53 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4933403O08RikF6UK53 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4933403O08RikF6UK53 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
4933403O08RikF6UK53 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
4933403O08RikF6UK53 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
4933403O08RikF6UK53 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
4933403O08RikF6UK53 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
4933403O08RikF6UK53 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
4933403O08RikF6UK53 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4933403O08RikF6UK53 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
4933403O08RikF6UK53 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4933403O08RikF6UK53 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4933403O08RikF6UK53 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
4933403O08RikF6UK53 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4933403O08RikF6UK53 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4933403O08RikF6UK53 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4933403O08RikF6UK53 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4933403O08RikF6UK53 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
4933403O08RikF6UK53 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
4933403O08RikF6UK53 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4933403O08RikF6UK53 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4933403O08RikF6UK53 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4933403O08RikF6UK53 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4933403O08RikF6UK53 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
4933403O08RikF6UK53 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4933403O08RikF6UK53 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4933403O08RikF6UK53 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4933403O08RikF6UK53 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4933403O08RikF6UK53 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4933403O08RikF6UK53 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4933403O08RikF6UK53 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4933403O08RikF6UK53 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4933403O08RikF6UK53 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
4933403O08RikF6UK53 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4933403O08RikF6UK53 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4933403O08RikF6UK53 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4933403O08RikF6UK53 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
4933403O08RikF6UK53 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4933403O08RikF6UK53 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4933403O08RikF6UK53 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4933403O08RikF6UK53 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4933403O08RikF6UK53 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4933403O08RikF6UK53 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
4933403O08RikF6UK53 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4933403O08RikF6UK53 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4933403O08RikF6UK53 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4933403O08RikF6UK53 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
4933403O08RikF6UK53 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4933403O08RikF6UK53 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4933403O08RikF6UK53 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4933403O08RikF6UK53 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4933403O08RikF6UK53 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4933403O08RikF6UK53 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms