Protein–RNA interactions for Protein: F2Z3U3

Raph1, Ras association (RalGDS/AF-6) and pleckstrin homology domains 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Raph1F2Z3U3 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Raph1F2Z3U3 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Raph1F2Z3U3 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Raph1F2Z3U3 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Raph1F2Z3U3 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Raph1F2Z3U3 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Raph1F2Z3U3 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Raph1F2Z3U3 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Raph1F2Z3U3 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Raph1F2Z3U3 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Raph1F2Z3U3 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Raph1F2Z3U3 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Raph1F2Z3U3 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Raph1F2Z3U3 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Raph1F2Z3U3 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Raph1F2Z3U3 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Raph1F2Z3U3 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Raph1F2Z3U3 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Raph1F2Z3U3 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Raph1F2Z3U3 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Raph1F2Z3U3 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Raph1F2Z3U3 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Raph1F2Z3U3 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Raph1F2Z3U3 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Raph1F2Z3U3 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Raph1F2Z3U3 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Raph1F2Z3U3 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Raph1F2Z3U3 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Raph1F2Z3U3 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Raph1F2Z3U3 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Raph1F2Z3U3 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Raph1F2Z3U3 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Raph1F2Z3U3 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Raph1F2Z3U3 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Raph1F2Z3U3 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Raph1F2Z3U3 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Raph1F2Z3U3 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Raph1F2Z3U3 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Raph1F2Z3U3 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Raph1F2Z3U3 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Raph1F2Z3U3 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Raph1F2Z3U3 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Raph1F2Z3U3 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Raph1F2Z3U3 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Raph1F2Z3U3 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Raph1F2Z3U3 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Raph1F2Z3U3 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Raph1F2Z3U3 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Raph1F2Z3U3 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Raph1F2Z3U3 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Raph1F2Z3U3 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Raph1F2Z3U3 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Raph1F2Z3U3 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Raph1F2Z3U3 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Raph1F2Z3U3 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Raph1F2Z3U3 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Raph1F2Z3U3 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Raph1F2Z3U3 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Raph1F2Z3U3 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Raph1F2Z3U3 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Raph1F2Z3U3 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Raph1F2Z3U3 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Raph1F2Z3U3 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Raph1F2Z3U3 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Raph1F2Z3U3 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Raph1F2Z3U3 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Raph1F2Z3U3 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Raph1F2Z3U3 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Raph1F2Z3U3 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Raph1F2Z3U3 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Raph1F2Z3U3 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Raph1F2Z3U3 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Raph1F2Z3U3 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Raph1F2Z3U3 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Raph1F2Z3U3 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Raph1F2Z3U3 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Raph1F2Z3U3 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Raph1F2Z3U3 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Raph1F2Z3U3 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Raph1F2Z3U3 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Raph1F2Z3U3 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Raph1F2Z3U3 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Raph1F2Z3U3 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Raph1F2Z3U3 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Raph1F2Z3U3 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Raph1F2Z3U3 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Raph1F2Z3U3 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Raph1F2Z3U3 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Raph1F2Z3U3 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Raph1F2Z3U3 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Raph1F2Z3U3 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Raph1F2Z3U3 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Raph1F2Z3U3 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Raph1F2Z3U3 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Raph1F2Z3U3 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Raph1F2Z3U3 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Raph1F2Z3U3 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Raph1F2Z3U3 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Raph1F2Z3U3 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Raph1F2Z3U3 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.2 ms