Protein–RNA interactions for Protein: E9QAP7

Taf4, TATA-box-binding protein-associated factor 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4E9QAP7 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Taf4E9QAP7 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Taf4E9QAP7 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Taf4E9QAP7 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Taf4E9QAP7 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Taf4E9QAP7 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Taf4E9QAP7 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Taf4E9QAP7 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Taf4E9QAP7 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Taf4E9QAP7 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Taf4E9QAP7 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Taf4E9QAP7 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Taf4E9QAP7 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Taf4E9QAP7 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Taf4E9QAP7 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Taf4E9QAP7 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Taf4E9QAP7 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Taf4E9QAP7 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Taf4E9QAP7 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Taf4E9QAP7 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Taf4E9QAP7 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Taf4E9QAP7 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Taf4E9QAP7 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Taf4E9QAP7 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Taf4E9QAP7 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Taf4E9QAP7 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Taf4E9QAP7 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Taf4E9QAP7 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Taf4E9QAP7 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Taf4E9QAP7 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Taf4E9QAP7 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Taf4E9QAP7 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Taf4E9QAP7 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Taf4E9QAP7 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Taf4E9QAP7 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Taf4E9QAP7 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Taf4E9QAP7 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Taf4E9QAP7 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Taf4E9QAP7 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Taf4E9QAP7 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Taf4E9QAP7 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Taf4E9QAP7 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Taf4E9QAP7 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Taf4E9QAP7 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Taf4E9QAP7 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Taf4E9QAP7 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Taf4E9QAP7 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Taf4E9QAP7 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Taf4E9QAP7 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Taf4E9QAP7 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Taf4E9QAP7 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Taf4E9QAP7 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Taf4E9QAP7 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Taf4E9QAP7 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Taf4E9QAP7 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Taf4E9QAP7 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Taf4E9QAP7 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Taf4E9QAP7 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Taf4E9QAP7 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Taf4E9QAP7 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Taf4E9QAP7 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Taf4E9QAP7 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Taf4E9QAP7 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Taf4E9QAP7 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Taf4E9QAP7 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Taf4E9QAP7 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Taf4E9QAP7 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Taf4E9QAP7 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Taf4E9QAP7 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Taf4E9QAP7 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Taf4E9QAP7 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Taf4E9QAP7 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Taf4E9QAP7 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Taf4E9QAP7 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Taf4E9QAP7 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Taf4E9QAP7 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Taf4E9QAP7 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Taf4E9QAP7 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Taf4E9QAP7 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Taf4E9QAP7 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Taf4E9QAP7 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Taf4E9QAP7 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Taf4E9QAP7 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Taf4E9QAP7 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Taf4E9QAP7 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Taf4E9QAP7 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Taf4E9QAP7 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Taf4E9QAP7 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Taf4E9QAP7 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Taf4E9QAP7 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Taf4E9QAP7 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Taf4E9QAP7 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Taf4E9QAP7 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Taf4E9QAP7 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Taf4E9QAP7 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Taf4E9QAP7 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Taf4E9QAP7 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Taf4E9QAP7 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Taf4E9QAP7 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Taf4E9QAP7 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms