Protein–RNA interactions for Protein: E9Q373

Vmn1r238, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r238E9Q373 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r238E9Q373 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r238E9Q373 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r238E9Q373 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r238E9Q373 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r238E9Q373 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r238E9Q373 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r238E9Q373 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r238E9Q373 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r238E9Q373 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r238E9Q373 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r238E9Q373 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r238E9Q373 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r238E9Q373 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r238E9Q373 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r238E9Q373 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r238E9Q373 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r238E9Q373 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r238E9Q373 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r238E9Q373 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r238E9Q373 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r238E9Q373 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r238E9Q373 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r238E9Q373 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r238E9Q373 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r238E9Q373 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r238E9Q373 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r238E9Q373 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r238E9Q373 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r238E9Q373 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r238E9Q373 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r238E9Q373 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r238E9Q373 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r238E9Q373 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r238E9Q373 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r238E9Q373 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r238E9Q373 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r238E9Q373 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r238E9Q373 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r238E9Q373 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r238E9Q373 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r238E9Q373 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r238E9Q373 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r238E9Q373 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r238E9Q373 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r238E9Q373 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r238E9Q373 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r238E9Q373 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r238E9Q373 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r238E9Q373 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r238E9Q373 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r238E9Q373 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r238E9Q373 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r238E9Q373 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r238E9Q373 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r238E9Q373 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r238E9Q373 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r238E9Q373 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r238E9Q373 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r238E9Q373 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r238E9Q373 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r238E9Q373 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r238E9Q373 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r238E9Q373 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r238E9Q373 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r238E9Q373 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r238E9Q373 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r238E9Q373 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r238E9Q373 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r238E9Q373 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r238E9Q373 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r238E9Q373 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r238E9Q373 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r238E9Q373 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r238E9Q373 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r238E9Q373 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r238E9Q373 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r238E9Q373 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r238E9Q373 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r238E9Q373 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r238E9Q373 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r238E9Q373 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r238E9Q373 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r238E9Q373 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r238E9Q373 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r238E9Q373 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r238E9Q373 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r238E9Q373 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r238E9Q373 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r238E9Q373 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r238E9Q373 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r238E9Q373 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r238E9Q373 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r238E9Q373 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r238E9Q373 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r238E9Q373 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r238E9Q373 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r238E9Q373 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r238E9Q373 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r238E9Q373 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms