Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fndc1E9Q043 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fndc1E9Q043 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Fndc1E9Q043 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Fndc1E9Q043 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Fndc1E9Q043 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Fndc1E9Q043 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Fndc1E9Q043 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Fndc1E9Q043 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Fndc1E9Q043 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Fndc1E9Q043 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Fndc1E9Q043 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Fndc1E9Q043 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Fndc1E9Q043 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fndc1E9Q043 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fndc1E9Q043 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fndc1E9Q043 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fndc1E9Q043 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fndc1E9Q043 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fndc1E9Q043 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fndc1E9Q043 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fndc1E9Q043 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fndc1E9Q043 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fndc1E9Q043 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fndc1E9Q043 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fndc1E9Q043 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fndc1E9Q043 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fndc1E9Q043 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fndc1E9Q043 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fndc1E9Q043 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fndc1E9Q043 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fndc1E9Q043 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fndc1E9Q043 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fndc1E9Q043 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fndc1E9Q043 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fndc1E9Q043 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fndc1E9Q043 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fndc1E9Q043 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fndc1E9Q043 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fndc1E9Q043 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fndc1E9Q043 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fndc1E9Q043 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fndc1E9Q043 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fndc1E9Q043 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fndc1E9Q043 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fndc1E9Q043 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fndc1E9Q043 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fndc1E9Q043 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fndc1E9Q043 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fndc1E9Q043 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fndc1E9Q043 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Fndc1E9Q043 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fndc1E9Q043 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fndc1E9Q043 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fndc1E9Q043 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fndc1E9Q043 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Fndc1E9Q043 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fndc1E9Q043 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fndc1E9Q043 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fndc1E9Q043 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fndc1E9Q043 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fndc1E9Q043 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fndc1E9Q043 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fndc1E9Q043 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Fndc1E9Q043 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fndc1E9Q043 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fndc1E9Q043 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fndc1E9Q043 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fndc1E9Q043 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fndc1E9Q043 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fndc1E9Q043 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fndc1E9Q043 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fndc1E9Q043 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Fndc1E9Q043 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Fndc1E9Q043 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fndc1E9Q043 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fndc1E9Q043 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fndc1E9Q043 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fndc1E9Q043 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fndc1E9Q043 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fndc1E9Q043 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fndc1E9Q043 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fndc1E9Q043 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fndc1E9Q043 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Fndc1E9Q043 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Fndc1E9Q043 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fndc1E9Q043 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fndc1E9Q043 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fndc1E9Q043 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fndc1E9Q043 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fndc1E9Q043 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fndc1E9Q043 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fndc1E9Q043 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fndc1E9Q043 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fndc1E9Q043 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fndc1E9Q043 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Fndc1E9Q043 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fndc1E9Q043 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fndc1E9Q043 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fndc1E9Q043 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms