Protein–RNA interactions for Protein: E9PVD1

Ccdc62, Coiled-coil domain-containing protein 62, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc62E9PVD1 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc62E9PVD1 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc62E9PVD1 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc62E9PVD1 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc62E9PVD1 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc62E9PVD1 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc62E9PVD1 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc62E9PVD1 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc62E9PVD1 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc62E9PVD1 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc62E9PVD1 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc62E9PVD1 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc62E9PVD1 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc62E9PVD1 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc62E9PVD1 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc62E9PVD1 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc62E9PVD1 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc62E9PVD1 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc62E9PVD1 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc62E9PVD1 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc62E9PVD1 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc62E9PVD1 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc62E9PVD1 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc62E9PVD1 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc62E9PVD1 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc62E9PVD1 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc62E9PVD1 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc62E9PVD1 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc62E9PVD1 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc62E9PVD1 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc62E9PVD1 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc62E9PVD1 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc62E9PVD1 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc62E9PVD1 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc62E9PVD1 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc62E9PVD1 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc62E9PVD1 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc62E9PVD1 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc62E9PVD1 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc62E9PVD1 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc62E9PVD1 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc62E9PVD1 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc62E9PVD1 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc62E9PVD1 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc62E9PVD1 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc62E9PVD1 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc62E9PVD1 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc62E9PVD1 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc62E9PVD1 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc62E9PVD1 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc62E9PVD1 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc62E9PVD1 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc62E9PVD1 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc62E9PVD1 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc62E9PVD1 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc62E9PVD1 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc62E9PVD1 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc62E9PVD1 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc62E9PVD1 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc62E9PVD1 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc62E9PVD1 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc62E9PVD1 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc62E9PVD1 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc62E9PVD1 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc62E9PVD1 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc62E9PVD1 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc62E9PVD1 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc62E9PVD1 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc62E9PVD1 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc62E9PVD1 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc62E9PVD1 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc62E9PVD1 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc62E9PVD1 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc62E9PVD1 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc62E9PVD1 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc62E9PVD1 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc62E9PVD1 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc62E9PVD1 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc62E9PVD1 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc62E9PVD1 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc62E9PVD1 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc62E9PVD1 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc62E9PVD1 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc62E9PVD1 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc62E9PVD1 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc62E9PVD1 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc62E9PVD1 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc62E9PVD1 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc62E9PVD1 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc62E9PVD1 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc62E9PVD1 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc62E9PVD1 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc62E9PVD1 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc62E9PVD1 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc62E9PVD1 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc62E9PVD1 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc62E9PVD1 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc62E9PVD1 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc62E9PVD1 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc62E9PVD1 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 115.3 ms