Protein–RNA interactions for Protein: E1U8D0

Soga1, Protein SOGA1, mousemouse

Predictions only

Length 1,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Soga1E1U8D0 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Soga1E1U8D0 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Soga1E1U8D0 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Soga1E1U8D0 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Soga1E1U8D0 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Soga1E1U8D0 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Soga1E1U8D0 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Soga1E1U8D0 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Soga1E1U8D0 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Soga1E1U8D0 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Soga1E1U8D0 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Soga1E1U8D0 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Soga1E1U8D0 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Soga1E1U8D0 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Soga1E1U8D0 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Soga1E1U8D0 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Soga1E1U8D0 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Soga1E1U8D0 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Soga1E1U8D0 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Soga1E1U8D0 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Soga1E1U8D0 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Soga1E1U8D0 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Soga1E1U8D0 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Soga1E1U8D0 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Soga1E1U8D0 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Soga1E1U8D0 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Soga1E1U8D0 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Soga1E1U8D0 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Soga1E1U8D0 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Soga1E1U8D0 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Soga1E1U8D0 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Soga1E1U8D0 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Soga1E1U8D0 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Soga1E1U8D0 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Soga1E1U8D0 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Soga1E1U8D0 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Soga1E1U8D0 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Soga1E1U8D0 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Soga1E1U8D0 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Soga1E1U8D0 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Soga1E1U8D0 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Soga1E1U8D0 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Soga1E1U8D0 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Soga1E1U8D0 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Soga1E1U8D0 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Soga1E1U8D0 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Soga1E1U8D0 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Soga1E1U8D0 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Soga1E1U8D0 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Soga1E1U8D0 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Soga1E1U8D0 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Soga1E1U8D0 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Soga1E1U8D0 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Soga1E1U8D0 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Soga1E1U8D0 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Soga1E1U8D0 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Soga1E1U8D0 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Soga1E1U8D0 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Soga1E1U8D0 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Soga1E1U8D0 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Soga1E1U8D0 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Soga1E1U8D0 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Soga1E1U8D0 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Soga1E1U8D0 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Soga1E1U8D0 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Soga1E1U8D0 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Soga1E1U8D0 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Soga1E1U8D0 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Soga1E1U8D0 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Soga1E1U8D0 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Soga1E1U8D0 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Soga1E1U8D0 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Soga1E1U8D0 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Soga1E1U8D0 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Soga1E1U8D0 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Soga1E1U8D0 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Soga1E1U8D0 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Soga1E1U8D0 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Soga1E1U8D0 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Soga1E1U8D0 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Soga1E1U8D0 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Soga1E1U8D0 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Soga1E1U8D0 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Soga1E1U8D0 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Soga1E1U8D0 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Soga1E1U8D0 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Soga1E1U8D0 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Soga1E1U8D0 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Soga1E1U8D0 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Soga1E1U8D0 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Soga1E1U8D0 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Soga1E1U8D0 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Soga1E1U8D0 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Soga1E1U8D0 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Soga1E1U8D0 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Soga1E1U8D0 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Soga1E1U8D0 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Soga1E1U8D0 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Soga1E1U8D0 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Soga1E1U8D0 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms