Protein–RNA interactions for Protein: D3YXL0

Ccdc170, Coiled-coil domain-containing 170, mousemouse

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc170D3YXL0 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc170D3YXL0 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc170D3YXL0 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc170D3YXL0 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc170D3YXL0 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc170D3YXL0 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc170D3YXL0 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc170D3YXL0 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc170D3YXL0 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc170D3YXL0 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc170D3YXL0 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc170D3YXL0 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc170D3YXL0 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc170D3YXL0 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc170D3YXL0 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc170D3YXL0 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc170D3YXL0 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc170D3YXL0 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc170D3YXL0 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc170D3YXL0 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc170D3YXL0 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc170D3YXL0 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc170D3YXL0 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc170D3YXL0 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc170D3YXL0 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc170D3YXL0 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc170D3YXL0 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc170D3YXL0 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc170D3YXL0 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc170D3YXL0 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc170D3YXL0 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc170D3YXL0 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc170D3YXL0 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc170D3YXL0 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc170D3YXL0 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc170D3YXL0 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc170D3YXL0 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc170D3YXL0 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc170D3YXL0 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc170D3YXL0 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc170D3YXL0 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc170D3YXL0 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc170D3YXL0 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc170D3YXL0 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc170D3YXL0 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc170D3YXL0 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc170D3YXL0 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc170D3YXL0 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc170D3YXL0 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc170D3YXL0 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc170D3YXL0 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc170D3YXL0 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc170D3YXL0 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc170D3YXL0 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc170D3YXL0 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc170D3YXL0 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc170D3YXL0 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc170D3YXL0 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc170D3YXL0 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc170D3YXL0 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc170D3YXL0 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc170D3YXL0 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc170D3YXL0 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc170D3YXL0 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc170D3YXL0 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc170D3YXL0 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc170D3YXL0 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc170D3YXL0 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc170D3YXL0 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc170D3YXL0 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc170D3YXL0 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc170D3YXL0 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc170D3YXL0 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc170D3YXL0 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc170D3YXL0 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc170D3YXL0 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc170D3YXL0 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc170D3YXL0 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc170D3YXL0 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc170D3YXL0 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc170D3YXL0 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc170D3YXL0 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc170D3YXL0 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc170D3YXL0 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc170D3YXL0 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc170D3YXL0 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc170D3YXL0 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc170D3YXL0 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc170D3YXL0 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc170D3YXL0 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc170D3YXL0 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc170D3YXL0 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc170D3YXL0 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc170D3YXL0 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc170D3YXL0 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc170D3YXL0 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc170D3YXL0 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc170D3YXL0 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc170D3YXL0 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc170D3YXL0 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms