Protein–RNA interactions for Protein: D3YV10

Ccdc13, Coiled-coil domain-containing protein 13, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc13D3YV10 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc13D3YV10 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc13D3YV10 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc13D3YV10 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc13D3YV10 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc13D3YV10 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc13D3YV10 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc13D3YV10 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc13D3YV10 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc13D3YV10 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc13D3YV10 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc13D3YV10 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc13D3YV10 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc13D3YV10 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc13D3YV10 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc13D3YV10 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc13D3YV10 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc13D3YV10 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc13D3YV10 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc13D3YV10 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc13D3YV10 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc13D3YV10 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc13D3YV10 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc13D3YV10 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc13D3YV10 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc13D3YV10 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc13D3YV10 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc13D3YV10 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc13D3YV10 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc13D3YV10 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc13D3YV10 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc13D3YV10 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc13D3YV10 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc13D3YV10 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc13D3YV10 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc13D3YV10 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc13D3YV10 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc13D3YV10 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc13D3YV10 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc13D3YV10 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc13D3YV10 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc13D3YV10 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc13D3YV10 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc13D3YV10 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc13D3YV10 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc13D3YV10 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc13D3YV10 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc13D3YV10 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc13D3YV10 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc13D3YV10 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc13D3YV10 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc13D3YV10 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc13D3YV10 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc13D3YV10 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc13D3YV10 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc13D3YV10 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc13D3YV10 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc13D3YV10 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc13D3YV10 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc13D3YV10 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc13D3YV10 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc13D3YV10 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc13D3YV10 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc13D3YV10 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc13D3YV10 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc13D3YV10 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc13D3YV10 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc13D3YV10 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc13D3YV10 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc13D3YV10 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc13D3YV10 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc13D3YV10 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc13D3YV10 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc13D3YV10 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc13D3YV10 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc13D3YV10 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc13D3YV10 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc13D3YV10 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc13D3YV10 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc13D3YV10 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc13D3YV10 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc13D3YV10 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc13D3YV10 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc13D3YV10 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc13D3YV10 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc13D3YV10 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc13D3YV10 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc13D3YV10 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc13D3YV10 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc13D3YV10 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc13D3YV10 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc13D3YV10 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc13D3YV10 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc13D3YV10 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc13D3YV10 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc13D3YV10 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc13D3YV10 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc13D3YV10 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc13D3YV10 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc13D3YV10 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms