Protein–RNA interactions for Protein: B2RV38

Rd3l, BC048943 protein, mousemouse

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Length 197 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3lB2RV38 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rd3lB2RV38 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Rd3lB2RV38 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Rd3lB2RV38 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Rd3lB2RV38 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Rd3lB2RV38 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rd3lB2RV38 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rd3lB2RV38 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Rd3lB2RV38 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rd3lB2RV38 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rd3lB2RV38 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rd3lB2RV38 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rd3lB2RV38 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Rd3lB2RV38 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rd3lB2RV38 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rd3lB2RV38 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rd3lB2RV38 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rd3lB2RV38 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rd3lB2RV38 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rd3lB2RV38 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rd3lB2RV38 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rd3lB2RV38 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rd3lB2RV38 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rd3lB2RV38 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rd3lB2RV38 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Rd3lB2RV38 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rd3lB2RV38 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rd3lB2RV38 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rd3lB2RV38 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rd3lB2RV38 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rd3lB2RV38 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rd3lB2RV38 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rd3lB2RV38 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rd3lB2RV38 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rd3lB2RV38 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rd3lB2RV38 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Rd3lB2RV38 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rd3lB2RV38 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rd3lB2RV38 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rd3lB2RV38 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rd3lB2RV38 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rd3lB2RV38 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rd3lB2RV38 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Rd3lB2RV38 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rd3lB2RV38 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rd3lB2RV38 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rd3lB2RV38 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rd3lB2RV38 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rd3lB2RV38 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rd3lB2RV38 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rd3lB2RV38 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rd3lB2RV38 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rd3lB2RV38 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rd3lB2RV38 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rd3lB2RV38 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rd3lB2RV38 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rd3lB2RV38 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rd3lB2RV38 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rd3lB2RV38 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rd3lB2RV38 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rd3lB2RV38 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rd3lB2RV38 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rd3lB2RV38 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rd3lB2RV38 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rd3lB2RV38 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Rd3lB2RV38 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rd3lB2RV38 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rd3lB2RV38 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rd3lB2RV38 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rd3lB2RV38 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rd3lB2RV38 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rd3lB2RV38 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rd3lB2RV38 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rd3lB2RV38 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rd3lB2RV38 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rd3lB2RV38 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rd3lB2RV38 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rd3lB2RV38 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rd3lB2RV38 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rd3lB2RV38 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rd3lB2RV38 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rd3lB2RV38 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rd3lB2RV38 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rd3lB2RV38 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rd3lB2RV38 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rd3lB2RV38 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rd3lB2RV38 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rd3lB2RV38 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rd3lB2RV38 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rd3lB2RV38 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rd3lB2RV38 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rd3lB2RV38 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rd3lB2RV38 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rd3lB2RV38 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rd3lB2RV38 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rd3lB2RV38 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Rd3lB2RV38 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rd3lB2RV38 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rd3lB2RV38 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rd3lB2RV38 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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