Protein–RNA interactions for Protein: A6H603

Nwd1, NACHT domain- and WD repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nwd1A6H603 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Nwd1A6H603 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nwd1A6H603 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nwd1A6H603 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nwd1A6H603 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nwd1A6H603 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Nwd1A6H603 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nwd1A6H603 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Nwd1A6H603 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nwd1A6H603 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nwd1A6H603 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nwd1A6H603 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nwd1A6H603 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nwd1A6H603 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nwd1A6H603 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nwd1A6H603 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nwd1A6H603 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nwd1A6H603 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nwd1A6H603 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nwd1A6H603 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Nwd1A6H603 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nwd1A6H603 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nwd1A6H603 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Nwd1A6H603 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nwd1A6H603 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nwd1A6H603 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nwd1A6H603 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nwd1A6H603 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nwd1A6H603 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nwd1A6H603 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nwd1A6H603 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nwd1A6H603 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nwd1A6H603 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nwd1A6H603 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nwd1A6H603 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nwd1A6H603 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nwd1A6H603 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nwd1A6H603 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nwd1A6H603 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nwd1A6H603 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nwd1A6H603 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nwd1A6H603 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nwd1A6H603 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nwd1A6H603 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nwd1A6H603 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nwd1A6H603 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Nwd1A6H603 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nwd1A6H603 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nwd1A6H603 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nwd1A6H603 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Nwd1A6H603 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Nwd1A6H603 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nwd1A6H603 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nwd1A6H603 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nwd1A6H603 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nwd1A6H603 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nwd1A6H603 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Nwd1A6H603 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nwd1A6H603 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nwd1A6H603 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nwd1A6H603 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nwd1A6H603 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nwd1A6H603 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nwd1A6H603 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nwd1A6H603 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nwd1A6H603 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nwd1A6H603 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nwd1A6H603 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nwd1A6H603 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Nwd1A6H603 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nwd1A6H603 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nwd1A6H603 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nwd1A6H603 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nwd1A6H603 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nwd1A6H603 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nwd1A6H603 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nwd1A6H603 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nwd1A6H603 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nwd1A6H603 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nwd1A6H603 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nwd1A6H603 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Nwd1A6H603 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nwd1A6H603 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nwd1A6H603 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nwd1A6H603 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nwd1A6H603 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nwd1A6H603 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nwd1A6H603 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nwd1A6H603 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nwd1A6H603 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nwd1A6H603 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nwd1A6H603 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nwd1A6H603 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nwd1A6H603 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nwd1A6H603 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nwd1A6H603 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nwd1A6H603 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nwd1A6H603 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nwd1A6H603 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nwd1A6H603 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms